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CCDS4907.2报告(当前版本)

CCDS公司 状态 物种 铬。 基因 CCDS发布 NCBI注释发布 信号群注释发布 链接
4907.2 公共 智人 6 VEGFA(血管内皮生长因子) 24 110 108 CCDS历史NCBI基因:7422通过CCDS ID:4907.2重新查询CCDS数据库通过GeneID:7422重新查询CCDS数据库参见序列查看器中6号染色体上的组合注释

CCDS 4907.1公共注释
编码区已更新为起始于上游非AUG(CUG)翻译起始密码子,这得到了保守数据和实验证据的支持,包括PMID中的数据:113526591156398611731620该位点的大多数公开获得的长mRNAs没有延伸到足够远的5',不包括CUG起始密码子,包括支持该变体的M27281.1。然而,BC058855.1、一些未拼接的部分转录本和上述出版物都支持转录起始进一步上游。因此,这种CCDS表示包括扩展的5’CDS。该基因还显示了从下游AUG密码子(Met-181)开始的替代翻译,这导致具有预测信号肽的较短亚型。该变体编码的较短亚型由CCDS 55009.1表示。

公开日期:CCDS版本1、NCBI注释版本35.1、集成注释版本23

审查状态:审查(由RefSeq、哈瓦那和CCDS合作)


属性
非AUG起始密码子

CCDS 4907.2中包含的序列ID

原件 当前 来源 核苷酸ID 蛋白质ID 鬃毛 CCDS中的状态 序号。状态 链接
原始成员 当前成员 EBI公司 ENST00000672860.3号机组 ENSP00000500082.3号文件 MANE选择 认可的 活着的 集成成绩单查看器链接:ENST00000672860.3集成蛋白质查看器链接:ENSP00000500082.3通过核苷酸ID重新查询CCDS数据库:ENST00000672860通过蛋白质ID:ENSP00000500082重新查询CCDS数据库
原始成员 当前成员 美国国立生物技术信息中心 NM_003376.6号 NP_003367.4号 MANE选择 认可的 活着的 核苷酸序列链接:NM_003376.6蛋白质序列链接:NP_003367.4通过核苷酸ID重新查询CCDS数据库:NM_003376通过蛋白质ID:NP_003367重新查询CCDS数据库BLAST链接:NP_003367.4

参考序列 长度 相关UniProtKB/SwissProt 长度 身份 差距 不匹配项
NP_003367.4号 395 第15692-13页 395 100% 0 0

CCDS 4907.2的染色体位置

装配GRCh38.p14(GCF_000001405.40)

6号染色体上的“+”链(NC_ 000006.12)
基因组浏览器链接:链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器参见序列查看器中6号染色体上的组合注释

染色体 起点 停止 链接
6 43770707 43771312 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43774341 43774392 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器6号染色体上的Ensembl基因组浏览器链接
6 43777469 43777665 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43778460 43778536 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43778889 43778918 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43780732 43780803 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43781956 43782087 链接到NCBI核苷酸6号染色体上的UCSC基因组浏览器链接连接到6号染色体上的集成基因组浏览器
6 43784541 43784562 链接到NCBI核苷酸链接到第6号染色体上的UCSC基因组浏览器连接到6号染色体上的集成基因组浏览器

CCDS序列数据
蓝色突出显示表示交替的外显子。
红色高亮显示表示通过剪接连接编码的氨基酸。
 
将鼠标悬停在下面的核苷酸或蛋白质序列上,单击突出显示的密码子或残基以选择该对。这也适用于“翻译例外”部分中的替换符号。

翻译例外:
替换符号(密码子CTG)M(M)在氨基酸位置1

核苷酸序列(1188 nt):
CTG公司ACG公司通用汽车公司AGA公司CAG公司ACA公司通用汽车公司行政协调会通用条款CCC公司自动增益控制CCC公司自动增益控制节气门执行器控制CAC公司反恐委员会反恐委员会CCC公司GGC公司CGG公司CGG公司CGG公司ACA公司G公司
TG公司
通用汽车公司GCG公司GCG公司GCG公司自动增益控制CGC公司GGG公司CAG公司GGG公司CCG公司GAG公司CCC公司GCG公司CCC公司GGA公司GGC公司GGG公司全球技术集团GAG公司GGG公司GTC公司GGG公司GC公司
T型
CGC公司GGC公司GTC公司全球合作协议CTG公司美国汽车协会CTT公司TTC公司GTC公司CAA公司CTT公司CTG公司GGC公司TGT公司TCT公司CGC公司TTC公司GGA公司GGA公司通用条款全球技术集团GTC公司CGC公司
GCG公司
GGG公司公认会计准则通用条款GAG公司CCG公司自动增益控制GGA公司通用条款GCG公司AGA公司AGT公司GCT公司自动增益控制TCG公司GGC公司CGG公司GAG公司GAG公司CCG公司CAG公司CCG公司GAG公司G公司
AG公司
GGG公司GAG公司GAG公司公认会计准则公认会计准则GAG公司AAG公司公认会计准则GAG公司GAG公司AGG公司GGG公司CCG公司CAG公司TGG公司CGA公司反恐委员会GGC公司GCT公司CGG公司AAG公司CCG公司GG公司
C类
TCA公司TGG公司ACG公司GGT公司GAG公司GCG公司GCG公司全球技术集团TGC公司全球合作协议通用汽车公司AGT公司GCT公司计算机辅助控制通用条款GCG公司CGC公司GCT公司CCC公司CAG公司通用条款CTG公司通用条款
CGG公司
通用条款TCG公司GGC公司CGG公司GGA公司GGA公司AGA公司通用技术协议GCT公司CGC公司CGA公司GGC公司通用条款GAG公司GAG公司自动增益控制GGG公司CCG公司CCC公司CAC公司自动增益控制CCG公司A类
GC公司
CGG公司AGA公司GGG公司自动增益控制GCG公司自动增益控制CGC公司通用条款GGC公司CCC公司GGT公司CGG公司通用条款TCC(变矩器离合器)公认会计准则行政协调会自动液位计AAC公司TTT公司CTG公司CTG公司TCT公司TG公司
G公司
全球技术集团CAT公司TGG公司自动增益控制CTT公司通用条款TTG公司CTG公司反恐委员会节气门执行器控制反恐委员会CAC公司CAT公司通用条款AAG公司TGG公司TCC(变矩器离合器)CAG公司GCT公司全球合作协议CCC公司自动液位计全球合作协议
公认会计准则
GGA公司GGA公司GGG公司CAG公司AAT公司CAT公司CAC公司公认会计准则G公司TG公司全球技术集团AAG公司TTC公司自动液位计关贸总协定GTC公司周转时间CAG公司CGC公司自动增益控制节气门执行器控制TGC公司CAT公司C类
加利福尼亚州
空中交通管制GAG公司行政协调会CTG公司全球技术集团通用汽车公司空中交通管制TTC公司CAG公司GAG公司节气门执行器控制CCT公司关贸总协定GAG公司空中交通管制GAG公司节气门执行器控制空中交通管制TTC公司AAG公司计算机辅助控制TCC(变矩器离合器)TG公司
T型
全球技术集团CCC公司CTG公司自动液位计CGA公司TGC公司GGG公司GGC公司TGC公司TGC公司AAT公司通用汽车公司GAG公司GGC公司CTG公司GAG公司TGT公司全球技术集团CCC公司ACT公司GAG公司GAG公司TCC(变矩器离合器)
AAC公司
空中交通管制行政协调会自动液位计CAG公司ATT公司自动液位计CGG公司空中交通管制美国汽车协会CCT公司CAC公司CAA公司GGC公司CAG公司CAC公司ATA公司GGA公司GAG公司自动液位计自动增益控制TTC公司CTA公司C类
AG公司
CAC公司AAC公司美国汽车协会TGT公司公认会计准则TGC公司AG公司A类计算机辅助控制AAG公司美国汽车协会关贸总协定AGA公司全球合作协议AGA公司CAA公司公认会计准则AA公司A类美国汽车协会TCA公司GTT公司CGA公司GGA公司AA公司
G公司
GGA公司AAG公司GGG公司CAA公司美国汽车协会CGA公司AAG公司CGC公司AAG公司美国汽车协会TCC(变矩器离合器)CGG公司周转时间AAG公司TCC(变矩器离合器)TGG公司自动增益控制燃气轮机T型CCC公司TGT公司GGG公司CCT公司TGC公司
TCA公司
GAG公司CGG公司AGA公司AAG公司CAT公司TTG公司TTT公司通用技术协议CAA公司关贸总协定CCG公司CAG公司ACG公司TGT公司美国汽车协会TGT公司TCC(变矩器离合器)TGC公司美国汽车协会AAC公司ACA公司通用汽车公司T型
CG公司
CGT公司TGC公司AAG公司GCG公司AGG公司CAG公司CTT公司GAG公司TTA公司AAC公司公认会计准则CGT公司ACT公司TGC公司AG公司A类TGT公司通用汽车公司AAG公司CCG公司AGG公司CGG公司TGA公司


翻译(395 aa):
M(M)T型D类T型D类T型A类P(P)S公司P(P)S公司Y(Y)H(H)P(P)G公司T型V(V)D类A类A类A类S公司G公司G公司P(P)E类P(P)A类P(P)G公司G公司G公司V(V)E类G公司V(V)G公司A类G公司V(V)A类K(K)F类V(V)G公司C类S公司F类G公司G公司A类V(V)V(V)
A类
G公司E类A类E类P(P)S公司G公司A类A类S公司A类S公司S公司G公司E类E类P(P)P(P)E类E类G公司E类E类E类E类E类K(K)E类E类E类G公司P(P)W公司G公司A类K(K)P(P)G公司S公司W公司T型G公司E类A类A类V(V)C类A类D类S公司A类P(P)A类A类A类P(P)A类A类
A类S公司G公司G公司G公司V(V)A类G公司A类E类E类S公司G公司P(P)P(P)H(H)S公司P(P)S公司G公司S公司A类S公司A类G公司P(P)G公司A类S公司E类T型M(M)N个F类S公司W公司V(V)H(H)W公司S公司A类Y(Y)H(H)H(H)A类K(K)
W公司S公司A类A类P(P)M(M)A类
E类
G公司G公司G公司N个H(H)H(H)E类
V(V)V(V)K(K)F类M(M)D类V(V)Y(Y)S公司Y(Y)C类H(H)P(P)E类T型V(V)D类F类E类Y(Y)P(P)D类E类E类Y(Y)F类K(K)P(P)S公司C类V(V)P(P)M(M)C类G公司G公司C类C类N个D类E类G公司E类C类V(V)P(P)T型E类E类S公司
N个
T型M(M)
M(M)K(K)P(P)H(H)G公司H(H)G公司E类M(M)S公司F类H(H)N个K(K)C类E类C类P(P)K(K)K(K)D类A类E类K(K)K(K)S公司V(V)G公司K(K)G公司K(K)G公司K(K)K(K)K(K)K(K)S公司Y(Y)K(K)S公司W公司S公司V(V)P(P)C类G公司P(P)C类
S公司
E类K(K)H(H)F类V(V)D类P(P)T型C类K(K)C类S公司C类K(K)N个T型D类S公司C类K(K)A类E类N个E类T型C类
C类D类K(K)P(P)



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