计算生物学

分析、可视化和建模生物数据和系统

迈斯沃克^®计算生物学产品提供执行各种操作的工具生物信息学和系统药理学应用的分析工作流。

使用应用程序或在命令行和在本地或集群环境中运行这些分析工作流。您可以查看和使用应用程序探索集成的下一代测序（NGS）数据，确定差异表达的基因或特征，并从中发现拷贝数变异NGS数据。

使用集成应用程序或在命令行中创建和分析动态模型定量系统药理学（QSP），基于生理的药代动力学（PBPK）和药代动力学/药效学（PK/PD）应用。例如，你可以运行并行仿真和参数扫描，以评估目标的可行性和描述生物变异性。您还可以使用局部和全局灵敏度关键参数识别与非线性模型参数估计分析回归和混合效应技术。然后，使用自动生成的报告和部署的应用程序。

计算生物学产品

生物信息学工具箱

读取、分析和可视化基因组和蛋白质组数据

模拟生物学

建模、模拟和分析生物系统

话题

下一代排序

使用Biopiple Designer计算RNA-Seq读数（生物信息学工具箱）
创建生物信息学管道，计算映射到基因组的RNA-Seq读取数特征。
使用基因组查看器应用程序可视化NGS数据（生物信息学工具箱）
查看细胞色素p450中单核苷酸变异的NGS比对数据基因。
从RNA-Seq数据中识别差异表达基因（生物信息学工具箱）
使用负二项模型测试RNA-Seq数据的差异表达基因。

定量系统药理学

使用SimBiology Model Builder将SGLT2抑制纳入基于生理学的葡萄糖-胰岛素模型（模拟生物学）
更新葡萄糖-胰岛素模型以整合钠-葡萄糖联合转运蛋白2（SGLT2）假想化合物对受体的抑制作用。
利用SimBiology模型分析仪进行全局敏感性分析，找出受体占用的重要参数（模拟生物学）
执行GSA分析，如Sobol指数、基本效应和多参数GSA，寻找靶向药物处置模型中的重要模型参数。
使用SimBiology模型分析仪探索虚拟患者的生物多样性（模拟生物学）
生成模型参数的样本值以表示虚拟患者，模拟探索肿瘤生长变异性，并研究给药方案对肿瘤的影响大小。

PBPK和PK/PD建模

建立受体-配体动力学模型（模拟生物学）
使用SimBiology应用程序创建并模拟一个简单的受体-受体动力学模型。
使用SimBiology模型分析仪计算NCA参数并将模型拟合到PK/PD数据（模拟生物学）
通过执行非部门分析和拟合来校准模型参数实验PKPD数据采用非线性回归。
新生儿苯巴比妥的群体药代动力学模型（模拟生物学）
使用临床药代动力学进行非线性混合效应建模数据。
评估药物的生物利用度（模拟生物学）
拟合药物昂丹司琼的吸收和排泄模型以估算其生物利用度。