网络分析-上传数据

InnateDB管理团队注释了25000个与先天免疫相关的分子相互作用-构建第一个先天免疫相互作用(参见我们的发表于BMC系统生物学的论文).虽然InnateDB管理侧重于先天免疫相关的交互作用,但innate数据库也包含了详细的注释就整个人类而言,小鼠和牛通过整合来自其他主要交互数据库的数据(352782+个交互)进行交互。InnateDB网络分析允许用户构建、可视化和分析分子相互作用网络兴趣及其编码产物是的组成部分。用户可能会发现未知的信号级联或通路,功能相关的子网络和这些网络的中心分子或中心。

要进行网络分析,首先上传基因/蛋白质的制表符分隔的文本文件或Excel电子表格(仅限.xls文件)标识符(仅限人类、小鼠或奶牛)和任何相关定量数据(例如基因表达数据fold-changes和p-values)从多达10个条件/时间点。请参阅我们的帮助页如果您不确定如何执行此操作并查看接受的ID。在选项页面上,您可以指定条件来过滤返回的交互列表

一旦你有了与你的基因/蛋白质列表相关的交互作用列表-点击页面顶部的“大脑”按钮对网络进行可视化和分析。

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