智人基因:NFKB2型
总结
InnateDB基因 IDBG-87893.6型
上次修改时间 2014-10-13[报告错误或提供反馈]
基因符号 NFKB2型
基因名称 B细胞2κ轻多肽基因增强子核因子(p49/p100)
同义词 CVID10;H2TF1;LYT-10;LYT10;NF-kB2;第100页;第52页
物种 智人
集合基因 ENSG00000077150号机组
编码蛋白质
B细胞2κ轻多肽基因增强子核因子(p49/p100)
B细胞2κ轻多肽基因增强子核因子(p49/p100)
B细胞2κ轻多肽基因增强子核因子(p49/p100)
B细胞2κ轻多肽基因增强子核因子(p49/p100)
蛋白质结构
有用的资源 茎形态学 EHFPI公司 ImmGen公司
InnateDB注释
总结
NFKB2(p49/p100亚单位)与RELB有效结合,上调NFKBIA(IKappaB-alpha)的合成。
NFKB2在调节RELA激活中起着关键作用,这表明NF-kappaB成员在规范和非规范通路信号传递中的功能重叠。
NFKB2重排基因产物(p58)定位于细胞核内,与RELA或RELB形成复合物,提示NFKB2基因重排可能是成人T细胞白血病(ATL)NF-kappaB组成性激活的一个因素,因此在ATL发病机制中发挥作用。
NFKB2通过与细胞质中的RELA、RELB、REL和NFKB1(p50)结合并抑制这些蛋白质进入细胞核来负调控TCR信号传导。
NFKB2通过TRAF3依赖性机制限制TNF诱导的小鼠骨吸收。
Orthologs的InnateDB注释
总结
【小家鼠】细菌细胞壁葡萄糖胺基-尿嘧啶二肽(GMDPs)与转录因子Ybx1结合,上调Nfkb2和Cxcr4基因表达。
Entrez基因
总结 该基因编码转录因子复合物核因子-κB(NFkB)的一个亚单位。NFkB转录因子复合物在多种细胞类型中表达,并作为炎症和免疫功能相关基因的中心激活物发挥作用。NFkB复合体可以由不同的亚单位组成,这些亚单位形成同源或异源二聚体,与靶基因中的特异性kappa-B元件结合。该基因编码p100亚单位,加工成活性p52亚单位。这种蛋白可以作为转录激活物和阻遏物,这取决于它的二聚体伴侣。交替拼接会产生编码和非编码变体。[由RefSeq提供,2012年5月]
该基因编码转录因子复合物核因子-κB(NFkB)的一个亚单位。NFkB复合物在多种细胞类型中表达,并作为炎症和免疫功能相关基因的中心激活物发挥作用。由该基因编码的蛋白质可以作为转录激活物或阻遏物,这取决于其二聚体伴侣。p100全长蛋白被共同翻译成p52活性形式。在B细胞淋巴瘤中观察到该位点的染色体重排和移位,其中一些可能导致融合蛋白的形成。该基因在第18号染色体上有一个假基因。选择性剪接导致多个转录变体。[由RefSeq提供,2013年12月]
基因信息
类型 蛋白质编码
基因组定位 染色体10:102394110-102402529
绞线 正向股
波段 q24.32问题
抄本
ENST00000336486标准
ENST00000369966号 欧洲标准P00000358983
ENST00000189444号 ENSP0000189444号
ENST00000428099标准 ENSP00000410256号
ENST00000471698号 ENSP0000471586标准
ENST00000467116号
ENST00000473400号机组
ENST00000601386标准 ENSP0000470826标准
ENST00000593908标准
ENST00000610498标准 ENSP0000480211号
互动
交互次数 该基因和/或其编码蛋白与123该数据库中经过实验验证的交互。
它们还与17正形学预测的相互作用。
实验验证
总计 123[视图]
蛋白质-蛋白质 89[视图]
蛋白质-DNA 33[视图]
蛋白质-RNA 0
DNA-DNA 1[视图]
RNA-RNA(核糖核酸) 0
DNA-RNA 0
由正畸学预测
总计 17[视图]
基因本体论

分子功能
加入 GO术语
去:0003677 DNA结合
通过:0003700 序列特异性DNA结合转录因子活性
去:0003713 转录辅激活子活性
去:0005515 蛋白质结合
生物过程
转到:0002224 toll样受体信号通路
去:0002268 滤泡树突状细胞分化
去:0002467 生发中心形成
去:0002755 MyD88依赖性toll样受体信号通路
去:0002756 MyD88依赖性toll样受体信号通路
去:0006351 转录,DNA模板
去:0006355 转录调控,以DNA为模板
去:0007165 信号转导
去:0030198 细胞外基质组织
去:0032481 I型干扰素产生的正调控
去:0034134 toll样受体2信号通路
去:0034138 toll样受体3信号通路
去:0034142 toll样受体4信号通路
去:0034146 toll样受体5信号通路
去:0034162 toll样受体9信号通路
去:0034166 toll样受体10信号通路
去:0035666 依赖TRIF的类toll受体信号通路
去:0038061 NIK/NF-kappaB信号
去:0038123 toll样受体TLR1:TLR2信号通路
去:0038124 toll样受体TLR6:TLR2信号通路
转到:0045087 先天免疫反应(InnateDB)
GO:0048536号 脾脏发育
GO:0051092号 NF-kappaB转录因子活性的正调控
蜂窝式组件
去:0005634
转到:0005654 核质
去:0005737 细胞质
去:0005829 细胞溶质
去:0033257 Bcl3/NF-kappaB2复合物
直系同源
物种
小家鼠
Bos金牛
基因ID
基因顺序
尚不可用
路径
NETPATH公司
TNFalpha途径
RANKL途径
TSLP途径
TWEAK途径
反应
RIP通过ZBP1途径介导NFkB活化
ZBP1(DAI)介导的I型干扰素途径的诱导
TRAF6介导的NF-kB活化途径
RIG-I/MDA5介导的IFN-α/β途径诱导
TAK1通过磷酸化和激活IKKs复合途径激活NFkB
MyD88依赖性级联途径
Toll样受体3(TLR3)级联途径
MyD88:在质膜途径上启动Mal级联反应
Toll样受体TLR1:TLR2级联途径
Toll样受体TLR6:TLR2级联途径
TRAF6介导的NFkB和MAP激酶对TLR7/8或9激活途径的诱导
内体途径启动MyD88依赖性级联反应
Toll样受体9(TLR9)级联途径
MyD88级联在质膜途径上启动
Toll样受体10(TLR10)级联途径
Toll样受体4(TLR4)级联途径
Toll样受体5(TLR5)级联途径
白细胞介素-1处理途径
Toll样受体7/8(TLR7/8)级联途径
免疫系统途径中的细胞因子信号转导
先天免疫系统途径
Toll样受体2(TLR2)级联途径
Toll样受体级联途径
DEx/H-box解旋酶激活I型干扰素和炎性细胞因子生成途径
免疫系统途径
白细胞介素途径的信号传递
激活的TLR4信号通路
TRIF介导的TLR3/TLR4信号通路
病原体相关DNA通路的细胞传感器
KEGG公司
MAPK信号通路
癌症途径中的途径
破骨细胞分化途径
国际职业卫生组织
PID网络控制接口
IL12介导的信号事件
替代NF-kappaB途径
交叉引用
瑞士保护银行
TrEMBL公司
UniProt拼接变量
Entrez基因
非重复序列 高73090 高742532
参考序列 纳米_001077494 NM_001261403 NM_001288724 NM_002502 XM_005269860号 XM_005269861号
雨果
OMIM公司
CCDS公司 CCDS41564号机组 CCDS41565号
HPRD公司 01239
IMGT公司
欧洲工商管理学院
GenPept公司
RNA序列图谱