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我们的故事
真核染色体由称为染色质的DNA-蛋白质复合物组成。了解染色质结构和基因组行为之间的关系是本项目的长期目标(NSF 1444532).我们的直接目标是利用核酸酶敏感性分析在五种不同玉米组织中鉴定和绘制染色质结构的全基因组变化。生化定义的DNS-seq图谱用于整合遗传、基因组和表观基因组信息。

性别化。ORG由Daniel Vera、Katie Kyle和Hank Bass使用UCSC浏览器开发,由FSU生物科学部主办。有关NUPRIME项目的更多信息,请访问maizenucleosome.org.

玉米DNS/差异核酸酶敏感性参考:

首次在多细胞生物中进行全基因组DNS分析:
(2014)Vera等人。植物细胞26(10):3883-3893. (内政部:10.1105/tpc.114.130609).

具有DNS-seq功能基因组学的GWAS:
(2016)Rodgers-Melnick等人。美国国家科学院113(22):E3177-E3184(内政部:10.1073/pnas.1525244113).

iSeg,一种新的基因组数据峰值调用算法:
(2018)Girimurugan等人。BMC生物信息学19:131(内政部:10.1186年/12859-018-2140-3年).

4种核心组织的玉米B73 DNS-seq图谱:
NCBI生物项目SRA账号:PRJNA445708(2018)Turpin等人。,简要数据2018年8月(内政部:10.1016/j.dib.2018.08.015).