信号群工具

我们提供了许多现成的工具来处理我们的数据和你的。我们通常在10天后从服务器中删除结果,但如果您有集成帐户您将能够无限期地保存结果。

处理您的数据

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变量效应预测器
[徽标]
通过我们的变量影响预测(VEP)工具分析您自己的变量并预测已知和未知变量的功能后果。工具50 MB*下载文档
变量记录器将变体标识符、HGVS符号或基因组SPDI符号转换为所有可能的变体ID、HGVS、VCF格式和基因组SPDI。工具建议使用Maximun 1000变体下载文档
爆破/爆破在我们的基因组中搜索你的DNA或蛋白质序列。工具50 MB文档
文件变色龙转换集成文件以与其他分析工具一起使用工具下载文档
装配转换器将数据的坐标映射(liftover)到当前程序集。工具50 MB文档
ID历史转换器将早期版本中的一组信号群ID转换为当前等效ID。工具50 MB下载文档
连杆不平衡计算器使用选定人群的基因型计算变异之间的LD。工具文档
VCF至PED转换器解析一个vcf文件以创建一个链接系谱文件(ped)和一个标记信息文件,这些文件可以一起加载到ld可视化工具(如Haploview)中。工具下载文档
数据分割器从BAM或VCF文件中获取数据子集。工具文档
*对于较大的数据集,我们提供了一个可以下载的API脚本(您还需要安装下面的Perl API来运行脚本)。

访问信号群数据

姓名描述从以下位置获取:文档
生物城使用此数据挖掘工具从Ensembl导出自定义数据集。Ensemb生物集市文档
Ensembl Perl API使用简单的Perl脚本对所有Ensembl数据进行编程访问githubFTP下载(仅限当前版本)文档
集成虚拟机带有Ubuntu桌面的VirtualBox虚拟机,预先配置了最新的Ensembl API和Variant Effect Predictor(VEP)。注意:下载量>1 GBFTP下载文档
集成REST服务器使用您喜爱的编程语言访问Ensembl数据rest.ensembl.org网站文档