数据分割器

数据切片器提供了一个界面,允许用户获取VCF的子部分(VCF工具)或BAM(SAM工具)基于基因组坐标的文件。

当前仅适用于GRCh37,您可以访问数据分割器从每个页面顶部的菜单栏中的工具链接。

首先,你可以选择命名你的工作。

然后您需要选择文件格式,VCF或BAM。

要选择要从中切片的区域,请键入染色体和坐标;例如1:1-50000。

如果您选择VCF作为格式,您将可以选择1000个基因组第3阶段、1000个基因组第一阶段或提供URL。对于BAM,您只能选择提供公开可见的URL。这些URL必须带有同名的tabix索引(.tbi)或BAM索引(.bai)。上的所有1000个基因组VCF和BAM文件FTP站点有这些指数。请注意,此服务仅适用于http上的其他BAM文件。

如果要对VCF文件进行切片,还可以按个人或人群对数据进行子集。您可以在框中放置以逗号分隔的个人或人群列表,也可以从下拉列表中选择个人或人群。如果要选择多个个人或群体,请按住ctrl键(在Windows/Linux上)或cmd键(Mac)。

单击“下一步”后,系统将生成最终文件。