ECMDB 2.0版

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ECMDB是一个经过专业管理的数据库,包含大量关于大肠杆菌(菌株K12,MG1655)的代谢组学数据和代谢途径图。该数据库包括Wishart实验室成员汇编的大量“原始”数据,以及来自数百本教科书、科学期刊、代谢重建和其他电子数据库的额外材料。ECMDB目前含有3755个小分子,1402个相关酶和387个相关转运蛋白。它还有1542个代谢途径,与3011个代谢产物有关。数据库中还包含3098种不同大肠杆菌代谢物的19294核磁共振和质谱(实验和预测)。每个代谢物都与100多个数据字段相关联,这些字段描述了化合物、其本体、物理特性、反应、途径、参考、外部链接和相关蛋白质或酶。


引用ECMDB

  1. Sajed,T.、Marcu,A.、Ramirez,M.、Pon,A.、Guo,A.、Knox,C.、Wilson,M.,Grant,J.、Djoumbou,Y.和Wishart,D.(2015)。ECMDB 2.0:了解大肠杆菌生物化学的丰富资源。《核酸研究》,第gkv1060页。26481353 .
  2. ECMDB:大肠杆菌代谢组数据库。Guo AC、Jewison T、Wilson M、Liu Y、Knox C、Djoumbou Y、Lo P、Mandal R、Krishnamurthy R、Wishart DS。核酸研究,2012年1月;41(数据库问题):D625-30。23109553 .