大卫·加瓦根
传记
我于1986年获得达拉谟大学数学学士学位。然后我搬到了牛津大学,1987年我在那里获得了数值分析和数学建模硕士学位,1991年获得了并行数值算法开发的DPhil学位。随后,我在数学和计算建模领域工作,建立并领导了计算生物学组主要总部位于牛津大学计算机科学系2004年,我被任命为计算生物学教授。我已经监督了30个DPhil项目的完成,目前我还参与了另外6个项目的监督。
DTC学生努力工作!
2002年,我获得了EPSRC的大量资助,用于建立和指导生命科学界面博士培训计划。这项创新的四年制DPhil课程是专门设计和量身定制的,旨在提供从数学和物理科学到生物医学和生命科学尖端研究的技术应用方面的综合培训。在初始计划成功后雷克斯·理查兹大厦现在我们的房子博士培训中心位于大学南公园路科学校园的中心。总的来说,RCUK的6000多万英镑资金和工业捐助国的1000多万英镑使我们能够提供一系列六个重点项目:系统生物学,生物医学科学的系统方法,合成生物学,跨学科生物科学,生物与医学合成、和生物医学成像。每年大约有40个学生名额,涉及一系列跨学科领域,其中包括少数国际学生。迄今为止,已有500多名学生注册了DTC课程;毕业生在工业和学术研究领域取得了成功,其中很大一部分人从事创业活动。
我在大学里还有其他几个职位,包括担任数学、物理和生命科学部.我还担任计算机科学系平等与多样性委员会主席;为了表彰我们对两性平等倡议的承诺,该部门获得铜牌雅典娜天鹅2015年4月授予。我是一个新学院.
在我的空闲时间,我喜欢跑步和指导我儿子的足球队。
利息
我的所有研究都是跨学科的,涉及数学和计算技术在生物医学问题上的应用。我的核心研究围绕着生理和生物系统的建模以及相关的测量技术展开:目前的重点领域包括哺乳动物心脏、肿瘤发展和电化学测量技术。
从我自己的DPhil研究开始,这些研究问题的计算复杂性导致了人们对使用最先进的计算设施以及开发必要的计算基础设施以支持研究科学家的长期兴趣。通过EPSRC综合生物学电子科学试点项目和BBSRC资助的电子科学项目IntBioSim等项目,这导致了英国电子科学项目的大力参与。
重点放在解决实际问题上,并为科学合作者提供有意义和实际的帮助。因此,我的所有工作都是与英国国内外国际领先的临床和实验小组合作进行的。我目前的资金来源包括EPSRC、BBSRC、EU Framework 7以及富士通、GE Healthcare、Microsoft Research、GSK和阿斯利康等行业赞助商。
项目
2020科学是一个合作研究项目,总部位于牛津大学、伦敦大学学院和剑桥微软研究院。重点是培养新一代的未来科学领导者:高度计算的自然科学家,能够用新方法解决基本问题。这一范围内所需的计算模型涵盖了从分子到系统、从生物体到生态系统,以及每种生物与环境的相互作用。为了跟上项目的进展,2020年科学计划运行了一个邮件列表.
Chaste公司(癌症、心脏和软组织环境)是一个开源C++库,用于模拟针对生物学和生理学中出现的多尺度、计算要求高的问题开发的数学模型。最初由心脏电生理学和癌症发展这两个应用驱动,Chaster不断发展,现在应用于更广泛的问题。该代码提供了用于处理常见科学计算组件的模块,例如普通和偏微分方程(ODE/PDE)的网格和解算器。重复使用这些组件可以避免研究人员在每个新项目中“重新发明轮子”,从而加快新应用的进展速度。您可以在Chaste用户的邮件列表.
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