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伪对称搜索
帮助
伪对称度估计
伪对称搜索
程序
DOPE公司
在结构的空间群的(最小)超群之间寻找结构中的伪对称。
程序的第一步是输入结构的数据。
可以使用表格提供数据,也可以从CIF文件加载数据。
结构所需的数据包括
国际结晶学表
,Vol A,晶格参数(单位为A和度),非对称单元中的原子数和相应的原子位置。
然后,有必要在执行搜索的超组类型中进行选择。
可用选项包括:
最小超群
给定Space组和索引的超组
一个著名变换矩阵的超群
另一种选择(仅适用于三斜和单斜群)是首先检查给定单元的伪对称性(获得给定角公差的可能晶格变换,并检查它们是否与空间超群变换兼容)。
填写完所有数据后,单击
[显示]
按钮搜索所选超组选项的伪对称。
注:
程序只接受
标准/默认设置
空间组的。
如果原始结构是根据
ITA设置
,程序
SETSTRU公司
可用于将其转换为标准设置。
对于更任意的非常规设置,工具
TRANSTRU公司
如果
转型
到标准设置是已知的。
如果你在准备论文时使用此程序,请以以下形式引用:
“C.Capillas、M.I.Aroyo和J.M.Perez-Mato,“伪对称性评估方法:原子位移和电子密度方法之间的比较”。
Z.克里斯特。
220
, 691-699 (2005).
请在文本区域输入结构数据(或加载CIF文件)。
公式
结构数据
[以CIF格式]
提示
:[给定文件名的选项优先]
提示
:[ATOM][ID][WP][X][Y][Z][OCC][Biso][SCAT]
初始结构(LS)
#空间组ITA编号
99
#晶格参数(长度(埃)和角度(度)
3.999 3.999 4.02 90 90 90
#非对称单元中的独立原子数
4
#[ATOM][ID][WP][X][Y][Z][OCC][Biso][SCAT]
钡1-0.000000 0.000000 0.00000 0.000000 1 0钡
钛2-0.500000 0.500000 0.420000 1 0钛
O 3-0.500000 0.500000 0.03 1 0 O
O 4-0.500000 0.000000 0.58 1 0 O
为伪对称搜索选择超组类型。
1.极小超群
[仅显示超级组表中的索引]
2.具有k指数的超群
我
k
:
1
2
三
4
3.指定超组转换
克:
Transf公司。
矩阵
(仅在选项2中)
线性部分
原点偏移
4.[*]具有最小超群的格伪对称
角度公差(度)
[*]仅适用于三斜和单斜。
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