Pyclaw输入/输出包 ¶
读取_ < 格式 > ( 解决方案 , 框架 , 路径 , 文件_前缀 , 写入_辅助 , 选项 )
其中输入是 输入 : 解决方案 - ( 解决方案 )Pyclaw对象为 输出 框架 -（int）帧编号 路径 -（string）根路径 文件_前缀 -（string）文件名的前缀。 写入_辅助 -（bool）布尔值，控制关联的 应该写出辅助数组。 选项 -（dict）可选参数字典
写入_ < 格式 > ( 解决方案 , 框架 , 路径 , 文件_前缀 , 写入_辅助 , 选项 )
其中输入是 输入 : 解决方案 - ( 解决方案 )Pyclaw对象为 输出 框架 -（int）帧编号 路径 -（string）根路径 文件_前缀 -（string）文件名的前缀。 写入_辅助 -（bool）布尔值，控制关联的 应该写出辅助数组。 选项 -（dict）可选参数字典。
注释
Pyclaw自动检测HDF5和NetCDF文件的可用性 如果您尝试在没有适当的 库。
pyclaw.fileio.ascii公司 ¶
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抓包.pyclaw.fileio.ascii。 阅读 ( 解决方案 , 框架 , 路径 = './' , 文件_前缀 = “堡垒” , 读_助 = False（错误） , 选项 = {} ) ¶ 读取ascii格式文件的帧，并将数据输入 解决方案对象。 此例程读取与经典文件相对应的ascii格式文件 抓取格式“fort.txxxx”、“fort.qxxxx”和“fort.axxxx”或“fort.aux” 请注意，fort前缀可以更改。 输入 : 解决方案 - ( 解决方案 )解决方案对象到 将数据读入。 框架 -（int）要读取的帧编号 路径 -（string）文件当前目录的路径 文件_前缀 -（string）要读入的文件的前缀。 违约 = “堡垒” 读_助 （bool）是否尝试读取辅助文件 英寸。 违约 = False（错误） 选项 -（dict）依赖于的可选参数字典 正在读取的格式。 违约 = {}
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抓包.pyclaw.fileio.ascii。 读取数组（_A） ( （f） , 状态 , 数值_var ) ¶ 从ASCII输出文件f读入数组。 这里的变量q实际上可能指q或aux。 此例程支持以下可能性： q[：，i，j，k]（对于固定的i，j 有些包每行只写4个值。 对于Clawback 6.0，我们计划让所有包都写 单行上的q[：，i，j，k]。 然后可以简化此例程。
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抓包.pyclaw.fileio.ascii。 读取patch_header ( （f） , 数字_尺寸 ) ¶ 阅读描述下一个补丁的标题 输入 : （f） -（file）打开文件的句柄 数字_尺寸 -（int）尺寸数
输出 : 补丁 -（clawpack.pyclaw.getometry.Patch）表示的初始化补丁 通过标题数据。
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爪包装。爪包装。文件。科学。 读取（_t） ( 框架 , 路径 = './' , 文件_前缀 = “堡垒” ) ¶ 只读fort-t文件并返回数据。 请注意，此文件始终为ascii，现在包含一行，表示 fileformat，因此我们可以在导入 解决方案数据的适当读取功能。 为了向后兼容，如果缺少file_format行，则 return None并在调用它的地方处理它。 此版本还读取num_ghost，因此如果数据是二进制的， 我们只能提取相关的数据（因为鬼细胞 包括）。 输入 : 框架 -（int）要读取的帧编号 路径 -（string）文件当前目录的路径 文件_前缀 -（string）要读入的文件的前缀。 违约 = “堡垒”
输出 : （list）输出变量列表 t吨 -（int）帧时间 数量（_eqn） -（int）框架中的方程式数量 nstates公司 -（int）状态数 数字_辅助 -（int）框架中的辅助值 数字_尺寸 -（int）q和aux中的尺寸数 数字_ghost -（int）每一侧的重影单元数 文件格式（_F） -（str）“ascii”，“binary32”，“二进制64”
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抓包.pyclaw.fileio.ascii。 写 ( 解决方案 , 框架 , 路径 , 文件_前缀 = “堡垒” , 写入_辅助 = False（错误） , 选项 = {} , 写入_p = False（错误） ) ¶ 写出ascii数据文件 写出一个与fortran clawpack文件格式相同的ascii文件 如有必要，包括写出fort.t、fort.q和fort.aux。 注释 假设每个补丁都有一些相同的参数 这种格式对实际数据对象来说不一定正确。 确保如果使用此输出格式，所有补丁程序都会共享 num_dim、num_eqn、num_aux和t的适当值。仅支持 高达3维。 输入 : 解决方案 - ( 解决方案 )Pyclaw对象 输出。 框架 -（int）帧编号 路径 -（string）根路径 文件_前缀 -（string）文件名的前缀。 违约 = “堡垒” 写入_辅助 -（bool）布尔值，控制关联的 应该写出辅助数组。 违约 = False（错误） 选项 -（dict）依赖于的可选参数字典 正在写入的格式。 违约 = {}
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抓包.pyclaw.fileio.ascii。 write_array（写入数组） ( （f） , 补丁 , q个 ) ¶ 写入单个数组以ASCII文本的形式输出文件f。 这里的变量q实际上可能指q或aux。
pyclaw.fileio.binary公司 ¶
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抓取.pyclaw.fileio.binary。 阅读 ( 解决方案 , 框架 , 路径 = './' , 文件_前缀 = “堡垒” , 读_助 = False（错误） , 选项 = {} ) ¶ 读入一组原始二进制文件 此例程读取二进制格式的文件 fort.txxxx包含有关帧的信息 fort.qxxxx仍然包含每个网格补丁的标题 fort.bxxxx是来自所有补丁的二进制数据转储。 fort.xxxx是所有补丁的辅助数组的二进制转储。 请注意，fort前缀可以更改。 输入 : 解决方案 - ( 解决方案 )解决方案对象到 将数据读入。 框架 -（int）要读取的帧编号 路径 -（string）文件当前目录的路径 文件_前缀 -（string）要读入的文件的前缀。 违约 = “堡垒” 读_助 （bool）是否从fort.xxxx读取辅助数据。 违约 = False（错误） 选项 -（dict）依赖于的可选参数字典 正在读取的格式。 违约 = {}
pyclaw.fileio.hdf5型 ¶
此模块通过以下任一模块读取和写入hdf5文件： h5py型- http://code.google.com/p/h5py/ Py表- http://www.pytables.org/moin网站
要安装其中之一，还必须从以下网站安装hdf5库：
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抓包.pyclaw.fileio.hdf5。 阅读 ( 解决方案 , 框架 , 路径 = './' , 文件_前缀 = “爪” , 读_助 = 真的 , 选项 = {} ) ¶ 将HDF5文件读入解决方案 输入 : 解决方案 - ( 解决方案 )Pyclaw对象为 输出 框架 -（int）帧编号 路径 -（string）根路径 文件_前缀 -（string）文件名的前缀。 违约 = “爪” 写入_辅助 -（bool）布尔值，控制关联的 应该写出辅助数组。 违约 = False（错误） 选项 -（dict）可选参数字典，不用于阅读。
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抓包.pyclaw.fileio.hdf5。 写 ( 解决方案 , 框架 , 路径 , 文件_前缀 = “爪” , 写入_辅助 = False（错误） , 选项 = {} , 写入（p） = False（错误） ) ¶ 写出HDF5文件的解决方案。 输入 : 解决方案 - ( 解决方案 )Pyclaw溶液 要输入的对象 框架 -（int）帧编号 路径 -（string）根路径 文件_前缀 -（string）文件名的前缀。 违约 = “爪” 写入_辅助 -（bool）布尔值，控制关联的 应该写出辅助数组。 违约 = False（错误） 选项 -（dict）可选参数字典，请参阅 HDF5选项表
钥匙 价值 压缩 （无，字符串[“gzip”|“lzf”|“szip”]或int 0-9） 启用数据集压缩。 除霜、LZF和（其中 可用）支持SZIP。 整数是 解释为向后的GZIP级别 兼容性。 压缩点（_O） （无，或特殊值）压缩设置 滤波器； 每个过滤器类型的合法值为： gzip公司 -（整数）0-9 里兹夫 -不允许使用 szip公司 -（tuple）2-tuple（'ec'|'nn'，偶数整数 0-32)
有关的详细说明，请参阅过滤器模块 每个过滤器。 大块 （None、True或shape tuple）将数据集存储在 分块格式。 如果任何 给出了其他关键字选项。 如果您不提供 一个形状元组，库将为您猜测一个。 洗牌 （True/False）启用/禁用数据洗牌，这可以 提高压缩性能。 自动 使用压缩时启用。 弗莱彻32 （真/假）启用Fletcher32错误检测； 可以 无论有无压缩都可以使用。
pyclaw.fileio.netcdf ¶
通过以下任一方式读取和写入NetCDF输出文件的例程
要安装netCDF 4库，请参阅：
作者 : Kyle T.Mandli（2009-02-17）初始版本
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抓包.pyclaw.fileio.netcdf。 阅读 ( 解决方案 , 框架 , 路径 = './' , 文件_前缀 = “爪” , 读_助 = 真的 , 选项 = {} ) ¶ 将NetCDF数据文件读入解决方案 输入 : 解决方案 - ( 解决方案 )Pyclaw对象为 输出 框架 -（int）帧编号 路径 -（string）根路径 文件_前缀 -（string）文件名的前缀。 违约 = “爪” 写入_辅助 -（bool）布尔值，控制关联的 应该写出辅助数组。 违约 = False（错误） 选项 -（dict）可选参数字典，未用于阅读。
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爪包.pyclaw.fileio.netcdf。 写 ( 解决方案 , 框架 , 路径 , 文件_前缀 = “爪” , 写入_辅助 = False（错误） , 选项 = {} , 写入_p = False（错误） ) ¶ 写出解决方案的NetCDF数据文件表示 输入 : 解决方案 - ( 解决方案 )Pyclaw对象为 输出 框架 -（int）帧编号 路径 -（string）根路径 文件_前缀 -（string）文件名的前缀。 违约 = “爪” 写入_辅助 -（bool）布尔值，控制关联的 应该写出辅助数组。 违约 = False（错误） 选项 -（dict）可选参数字典，请参阅 NetCDF选项表
钥匙 价值 描述 键/值对字典 作为属性附加到根组， 即{“时间”：3} 格式 可以是以下netCDF风格之一： NETCDF3_类，NETCDF_3_64位， NETCDF4_CLASSIC和NETCDF4 违约 = 网络cdf4 痛打 如果为True（默认），则文件将被覆盖， 如果为False，将引发异常 zlib公司 如果为True，则分配给变量的数据 实例已压缩到磁盘上。 违约 = False（错误） 复合层 要使用的zlib压缩级别（1是 最快但最差的压缩是9 最慢但最好的压缩）。 忽略 如果zlib=False。 违约 = 6 洗牌 如果为True，则应用HDF5洗牌过滤器 以提高压缩性能。 忽略，如果 zlib=假。 违约 = 真的 活页夹32 如果为True（默认为False），则Fletcher32 校验和算法用于错误 检测。 相邻的 如果为True（默认为False），则变量数据 连续存储在磁盘上。 设置为 对于不受限制的变量为True 维度将触发错误。 违约 = False（错误） 块状大小 可用于指定HDF5块大小 对于变量的每个维度。 A类 详细讨论HDF分块和I/O 这里提供性能。 基本上， 您需要每个维度的块大小 尽可能地匹配 用户将从中读取的数据块 文件。 如果 continuous=True。 最小有效位数 如果指定，变量数据将为 截断（量化）。 与 zlib=True这会产生“有损”，但是 显著提高压缩效率。 例如，如果least_significant_digit=1， 数据将使用around进行量化 （刻度*数据）/刻度，其中刻度=2**位， 并确定位，以便 保留0.1（在这种情况下，位=4）。 违约 = 无 ，或不进行量化。 字节存储次序 可用于控制数据是否 以小端或大端格式存储在 磁盘。 可能的值有小、大或 本机（默认）。 图书馆将 自动处理endian转换 数据被读取，但如果数据总是 将在计算机上用 与用于创建的格式相反 文件，可能有一些性能 通过设置 末日意识。 fill_value（填充值） 如果指定，默认netCDF_FillValue （填充变量的值 在写入任何数据之前） 替换为该值。 如果fill_value为 设置为False，则变量不是 预先填充。 注释 zlib、complevel、shuffle、fletcher32、continuous、chunksize和 对于不使用 使用HDF5。
