Sparky-核磁共振分配和集成软件

建议:下面的UCSF Sparky分布是旧的,没有维护。
请使用Sparky的继任者波基(Poky)由Woonghee Lee(2015-2021+)开发。
在上提问NMR Sparky谷歌集团.

2008年5月30日修订

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Sparky是一个图形化核磁共振赋值和集成程序用于蛋白质、核酸和其他聚合物。有关Sparky的更多信息,请参阅简介在中手册.你也可能对其他核磁共振软件.

新闻

请使用NMRFAM火花由Woonghee Lee(2017)积极开发。下面的UCSF Sparky分布是旧的,没有维护。

请直接向NMR Sparky谷歌集团.前者雅虎群组不再使用。

下载

闪耀的二进制分布
操作系统硬件分发版本日期
Windows XP、Vista和7x86(x86)sparky-win32.zip 3.1147/12/07
Mac OS 10.4.11及更新版本英特尔sparky-mac10.4-英寸.dmg 3.1155/30/08
Mac OS 10.3.9及更新版本第四集团火花-mac10.3-ppc.dmg 3.1152008年5月30日
Linux 2.6.18及更新版本x86 64位sparky-linux2.6-64位.tar.gz 3.1158/6/14
Linux 2.6.9及更新版本x86 32位sparky-linu公司2.6.tar.gz 3.11310/13/06

安装说明描述如何解压缩分发包。

这个许可证说Sparky对所有用户都是免费的。右边是一个地图自2002年起,共有个注册地点。

这个更改日志文件将帮助您决定是否值得更新您的Sparky版本。

分布大约为20 MB,包括一些样本数据和Python语言。

该表列出了用于编译Sparky的操作系统版本。这些版本可以在这些操作系统的较旧或较新版本上运行。请告诉我(sparky@cgl.ucsf.edu)它是否在您的操作系统上运行,我将包括这一点此处显示信息。

较早的Sparky版本适用于较旧的操作系统和机器。

源代码(版本3.115)可用。它可以在上面列出的平台以外的平台上编译。您需要Tcl/Tk 8.4、一个C++编译器和很多耐心。

扩展

闪亮的脚本Andrew Perry提供了有关使用CYANA和XEASY文件的信息。

闪闪发光的工具输出BMRB提交表,计算化学位移指数,并输出XPLOR-NIH距离约束尼古拉斯·萨佩(Nicolas Sapay)提供。

一个扩展转换XEASY峰值列表Enrico Morelli提供Sparky格式。这是为了得到CYANA和GARANT输出到Sparky。

你可以写入扩展名,访问峰值和频谱数据并使用显示器的小程序Sparky的功能,使用Python语言.2006年3月10日之后,它包含在Sparky分布中。Python网站http://www.python.org(英文).

问题

有关Sparky的问题,请尝试NMR Sparky讨论组(电子邮件nmr_sparky@yahoogroups.com).

没有常见问题解答。

闪闪发光发展状况请求的功能漏洞.

引用Sparky

如果您使用NMRFAM Sparky,请引用

	NMRFAM-SPARKY:生物分子核磁共振波谱增强软件。Lee W、Tonelli M、Markley JL。生物信息学。2015年4月15日;31(8):1325-7.

我们还没有写过一篇描述UCSF Sparky的论文。如果发布使用UCSF Sparky的作品,可以引用为:

T.D.Goddard和D.G.Kneller,SPARKY 3,加利福尼亚大学旧金山分校

托马斯·戈达德/goddard@cgl.ucsf.edu公司