蛋白质结构几乎总是比序列更保守。因此，当两个蛋白质具有显著的序列相似性时，它们也极有可能具有相似的3D结构。

以下说明演示了如何在自己的蛋白质序列上找到重要的CATH结构域匹配。

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结果

• 结果显示了与您的蛋白质序列最相似的CATH结构域的位置
• 每个结果都有链接以了解更多关于。。。
  • 特定的匹配CATH域
  • 匹配域所属的超家族

CATH-Gene3D通过序列、结构和功能注释数据提供蛋白质结构域进化关系的信息。

与进化相关的CATH等级分类群域的同源超家族（H）水平(了解有关分类过程的更多信息).

相对较少的CATH超家族已经发展出高水平的序列、结构和功能多样性在进化过程中。尽管结构多样性很高，但仍观察到这些超家族成员共享一个保守的结构核心。

在域演化分析中考虑了以下因素：

序列多样性

超家族亲属在不同程度的结构域序列相似性上聚集：35%、60%、95%和100%。如果超家族具有多个簇且序列一致性为35%，则通常被描述为序列多样。CATH超家族网页上的分类/域选项卡提供了一个交互式图表，用于探索所有不同类型的序列簇。

结构多样性

超家族中的结构多样性可以通过观察它所包含的结构相似的群体（或SSG）的数量来衡量。CATH-Gene3D超家族网页上的“超级家族叠加”选项卡表明，即使是结构多样的超家族也有一个共同的结构核心。

功能多样性

具有相似序列属性的超家族亲属被聚集成功能家族（或FunFam）。FunFam在预测功能和提供功能进化信息方面非常有用。

蛋白质通常由一个或多个构建块组成，称为结构域。蛋白质结构域通常被认为是独立的结构单元。

在超家族中，CATH-Gene3D创建了功能家族（FunFam），旨在将共享相同功能的域组合在一起。因此，如果蛋白质序列的一个区域提供了与特定CATH-Gene3D FunFam高度匹配，则很可能它们共享类似功能。

为了验证这一论断，我们的功能预测管道（基于这些FunFam）被提交给了蛋白质功能注释的关键评估（CAFA）。根据许多不同的评分方法，我们的方法在功能预测的准确性方面排名很高。

以下说明演示了如何为自己的蛋白质序列查找功能注释。

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结果

web服务器的输出提供：

• 查询序列与CATH-Gene3D域超家族和FunFam ID的最佳匹配
• 用于匹配FunFam的酶委员会（EC）和基因本体（GO）注释。

CATH-Gene3D中的蛋白质域超家族已被分为功能家族（或FunFams），这些功能家族是一组具有相同功能的蛋白质序列和结构。因此，家族中具有重要功能的残基也有望高度保守。

CATH-Gene3D FunFam校准中的保守位置信息通过FunFamWeb页面的校准选项卡显示。已使用Scorecon计算了保护分数，并使用彩虹颜色方案对路线中的列进行了着色，其中高度保守的残基以红色显示到完全不保守的位置，以蓝色显示。保存分数也被映射到具有代表性的蛋白质结构域结构上。

要调查蛋白质序列的假定保守位点，请对FunFam进行序列搜索，然后单击FunFam-match Alignment页面。

我们的目标是每12个月提供CATH分类的官方发布。这个发布过程很重要，因为它允许我们提供内部验证、额外注释和分析。然而，这可能意味着PDB中出现的新结构与最新的官方CATH发布之间存在时间延迟

为了解决这个问题：CATH-B为最新的域注释（例如域边界和超家族分类）提供了有限的信息。该信息称为CATH-B