白色念珠菌 RAD51/CR_02200C型总结

上次策划时间：2023-05-23
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总结

RAD51系列基本信息[查看参考]

标准名称

RAD51系列¹

系统名称，参考菌株

CR_02200C_A号(白色念珠菌SC5314)

组件19/21标识符

或19.3752

别名

或19.11236，IPF15096.2，IPF7787.2²，连续4-1795_0004^三，连续4-1795_0005^三，或6.4214⁴，或6.615⁴，CA2347²，CaO19.3752⁵，或19.3752，CR_02200C_B，CR_02200C

功能类型

ORF，已验证

描述

参与同源重组和DNA修复的蛋白质；氟胞嘧啶诱导；null突变体生长缓慢，白-不透明切换频率增加(1,6,7)

文学

Allele名称

CR_02200C_B型

等位基因变异

等位基因之间的同义变异
特征起始坐标上游100 bp内等位基因之间的序列变异

CUG密码

CR_02200C_A:0号
CR_02200C_B:0号

其他菌株使用的系统名称

CAWG_01566号(白色念珠菌WO-1)

中的同源基因念珠菌物种

杜氏梭菌CD36正交测井：抄送36_27150
副psilosis梭菌CDC317正交测井：CPAR2_801420号
金黄色葡萄球菌B8441正交测井：B9J08_001108/RAD51
光滑梭菌CBS138正交测井：CAGL0I05544克
查看正交簇：19个基因中的19个念珠菌-相关物种/菌株

非CGD物种的正态分布

A.鸟巢(紫外分光光度计) ;N.克拉萨(梅-3) ;S.pombe公司(SPAC644.14c系列) ;酿酒酵母(RAD51系列)

J罗兹

JBrowse用于功能部件CR_02200C_A

GO注释		查看全部RAD51系列GO证据和参考
分子功能
计算型		ATP绑定(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) ATP依赖性活性，作用于DNA(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列,酿酒酵母:RAD51系列) ATP酶(国际原子能机构使用EBI：AAA+ATP酶域) DNA结合(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列) DNA链交换活性(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列,酿酒酵母:RAD51系列) Swi5-Sfr1复合绑定(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) 双链DNA结合(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列,酿酒酵母:RAD51系列) 核苷酸结合(国际原子能机构使用EBI：DNA修复Rad51/转录因子NusA，α-螺旋) 单链DNA结合(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列,酿酒酵母:RAD51系列)
生物过程
手动管理		同源重组修复双链断裂(进口) 丝状生长(进口) 单细胞生物种群的丝状生长(进口) 单细胞生物种群丝状生长的负调控(进口) 表型转换(进口) DNA稳定性的调节(进口) 丝状菌生长的调控(进口)
计算型		DNA重组酶组装(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) DNA重组(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c公司,酿酒酵母:RAD51系列) DNA链侵入(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列,酿酒酵母:RAD51系列) 双链断裂修复(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列) 减数分裂重组中的双链断裂修复(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) 同源重组修复双链断裂(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) 麦角甾醇生物合成过程(远程控制卡) 异源双链形成(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列) 配对式开关(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c公司) 减数分裂联合分子形成(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列) 减数分裂链侵入(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) 线粒体DNA修复(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列) 有丝分裂重组(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) 有丝分裂重组依赖性复制分叉处理(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) 核苷酸切除修复(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列) 互惠减数分裂重组(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列) 重组品牌间交联修复(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) 暂停的复制分叉定位到核外围(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) 端粒维持(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) 通过重组维持端粒(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列)
蜂窝组件
计算型		染色体着丝粒区(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列) 浓缩核染色体(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列) 线粒体基质(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列) 核染色体(国际原子能机构具有酿酒酵母:RAD51系列) 双绞线断裂位置(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC644.14c系列)

突变表型		查看全部RAD51系列表型细节和参考
经典遗传学
杂合性缺失		抗紫外线：降低
纯合零		抗紫外线：降低丝状生长：增加氧化应激抵抗力下降表型转换：增加博莱霉素耐药性下降喜树碱耐药性下降对甲酰胺的抗性降低羟基脲抗性降低甲基磺酸甲酯抗性下降对叔丁基过氧化氢的抗性降低耐热性：降低营养生长：下降率可行的毒力：降低
大规模调查
空		不可侵犯的

序列信息

Ca22chrRA_C_albicans_SC5314:485110至484025|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。

上次更新时间

协调: 2016-01-21 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息

		相对协调				染色体协调				最新更新
		相对协调				染色体协调				协调		顺序
光盘		1	到	1086		485,110	到	484,025		2016-01-21		2014-06-24

检索序列
序列分析工具
地图和显示器

小巷位置
Allele路CR_02200C_B

Ca22chrRB_C_albicans_SC5314:485092至484007|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。

上次更新时间

协调: 2016-01-21 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息

		相对协调				染色体协调				最新更新
		相对协调				染色体协调				协调		顺序
光盘		1	到	1086		485,092	到	484,007		2016-01-21		2014-06-24

外部链接

主要CGDID

CAL0000180182

其他信息RAD51系列

基因/序列资源

本页引用的参考文献[查看的完整文献指南RAD51系列]

1)	*刘TT，等人。(2005)白色念珠菌对唑类、多烯类、棘白菌素和嘧啶类抗真菌药物反应的基因组表达谱。抗菌剂Chemother*49(6):2226-36
2)	CandidaDB公司
3)	伯曼J（2005）将程序集4中的ORF映射到程序集19中的ORFs。
4)	CGD（2005）orf6和orf19预测蛋白质产物的CGD比较。
5)	*Maglott D公司，等人。(2007)Entrez Gene：NCBI以基因为中心的信息。核酸研究*35（数据库问题）：D26-31
6)	Alby K和Bennett RJ（2009）应激诱导的白色念珠菌表型转换。分子生物学细胞20（14）：3178-91
7)	*加西亚-普利托F，等人。（2010年）同源重组基因RAD51和RAD59在白色念珠菌对紫外线、辐射模拟物和抗肿瘤化合物及氧化剂的抗性中的作用。真菌基因生物*47(5):433-45

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引用CGD，请使用以下内容参考：Skrzypek MS、Binkley J、Binkley G、Miyasato SR、Simison M、Sherlock G（2017）。念珠菌基因组数据库（CGD）：纳入组装22、系统标识符和高通量测序数据可视化。核酸研究 45（D1）；D592-D596；看见如何引用CGD。

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