光滑梭菌 YOR1/CAGL0G00242g总结

上次策划时间：2022-04-06
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总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
第1年 基本信息[查看参考]
标准名称 第1年1
系统名称，参考菌株 CAGL0G00242克(光滑梭菌CBS138)
别名 CAGL-IPF8922、CAGL-CDS0113.1、CAG59302.1、GVI51_G001212
要素类型 ORF，无特征
描述 推测ABC转运体参与多药外排；突变抑制TOR和钙调神经磷酸酶信号；耐氮唑菌株中基因上调(三,4)
文学类
中的同源基因念珠菌物种 C.近矽肺CDC317正交测井：CPAR2_407200
金黄色葡萄球菌B8441正交测井：B9J08_003323
杜氏梭菌CD36正交测井：抄送36_24060
白色念珠菌SC5314正交对数：C2_09990C_A/约尔1
查看正交对数聚类：19个基因中的19个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种的正态分布 A.鸟巢(cicA公司) ;N.克拉萨(NCU04161型) ;酿酒酵母(第1年)
非CGD物种中的最佳点击 S.pombe公司(SPAC3F10.11c系列)
J罗兹

功能部件CAGL0G00242g的JBrowse

GO注释 查看全部第1年GO证据和参考

分子功能		  
计算 * ABC型转运蛋白活性(国际能源署使用EBI：ABC转运蛋白1型，跨膜结构域)
* ABC型外源性转运体活性(国际能源署具有酿酒酵母:第1年)
* ATP绑定(国际能源署使用EBI：ABC转运蛋白1型，跨膜结构域超家族，EBI：ABC转运蛋白样，ATP-结合域，EBI：ABC转运蛋白1型，跨膜结构域，EBI：ABC转运蛋白样保守位点)
* ATP酶(国际能源署使用EBI：AAA+ATP酶域，EBI：ABC转运蛋白样，ATP-结合域，EBI：ABC转运蛋白样保守位点)

生物过程		  
计算型 * 跨膜转运(国际能源署息税前利润：ABC转运蛋白1型，跨膜结构域)
* 外源运输(国际能源署具有酿酒酵母:第1年)

蜂窝组件		  
计算型 * 薄膜(国际能源署使用EBI：ABC转运蛋白1型，跨膜结构域超家族，EBI：ABC转运蛋白1型，跨膜结构域)
* 质膜(国际能源署具有酿酒酵母:第1年)
突变表型 查看全部第1年表型细节和参考
经典遗传学
空 * 对唑类药物的耐药性降低
* 可行的

大规模调查
无效 * 生物膜形成：减少
* 可行的

序列信息 折叠 ChrG_C_glabata_CBS138:38454至34021|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 协调: 2022-08-29 |顺序: 2022-08-29

子功能详细信息
相对
协调		染色体
协调		最新更新
协调顺序
5英尺UTR-213到-138,667到38,4552022-08-292022-08-29
客户尽职调查1到443438,454到34,0212022-08-292022-08-29
3英尺UTR4435到602434,020到32431个2022-08-292022-08-29

检索序列
序列分析工具
地图和显示
外部链接 CGOB公司|FungiDB公司|GenBank（基因银行）(1,2) |基因水平|InterPro公司(1,2,三,4,5,6) |快速GO|TrEMBL公司
主要CGDID CAL0130663号
其他信息第1年
轨迹历史基因/序列资源
LOCUS总结注释第1年（上次更新时间：2010-10-21）
注：与uniprot非常相似| P53049酵母菌属酿酒YGR281w YOR1 ATP结合盒转运蛋白
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南第1年]
1)蔡海飞，等。(2010)光滑念珠菌口咽分离物中唑类耐药机制的微阵列和分子分析。抗菌剂Chemother54(8):3308-17
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  数据  
2)徐Z，等。(2021)光滑念珠菌的从头基因组组装揭示了细胞壁蛋白补体和离散串联重复序列的结构摩尔微生物113:1209-1224
CGD论文录入  Pubmed条目  Web增补  数据  
3)Vermitsky JP，等。(2006)Pdr1调节光滑念珠菌的多药耐药性：基因破坏和全基因组表达研究。摩尔微生物61(3):704-22
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4)库马里S，等。(2022)光滑念珠菌雷帕霉素靶点（TOR）和钙调神经磷酸酶信号转导的CgYor1依赖性唑类抗生素耐药性的揭示MBio公司
CGD论文录入  Pubmed条目  

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