光滑梭菌 PDR1/CAGL0A00451g总结

上次策划时间：2024-06-01
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总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
PDR1（PDR1） 基本信息[查看参考]
标准名称 PDR1（PDR1）1
系统名称，参考菌株 CAGL0A00451克(光滑梭菌CBS138)
别名 ZCF1型2
CAGL-IPF3325、CAGL-CDS0315.1、CAG57683.1、GVI51_A00319三
要素类型 ORF，已验证
描述 锌指转录因子，通过多效性药物反应元件激活耐药基因（PDRE）；调节药物外排泵并控制多药耐药性；耐唑菌株的基因上调和/或突变(1,4,5,6,7,8)
文学类
中的同源基因念珠菌物种 查看正交簇：2个基因中有2个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种的正态分布 酿酒酵母(PDR1（PDR1）)
非CGD物种中的最佳点击 A.鸟巢(AN2852型) ;N.克拉萨(NCU00155型) ;S.pombe公司(spbc16克5.16)
J罗兹

功能部件CAGL0A00451g的JBrowse

GO注释 查看全部PDR1（PDR1）GO证据和参考

分子功能		  
手动管理 * DNA结合转录因子活性(国际开发协会)
* 序列特异性DNA结合(国际开发协会)
计算型 * DNA结合转录激活物活性，RNA聚合酶Ⅱ特异性(国际能源署具有酿酒酵母:PDR1（PDR1）)
* DNA结合转录因子活性，RNA聚合酶Ⅱ特异性(国际能源署使用EBI：Zn（2）Cys（6）真菌型DNA结合结构域，EBI：Zn（2）-C6真菌型DNA结合域超家族)
* 锌离子结合(国际能源署使用EBI：Zn（2）Cys（6）真菌型DNA结合域，EBI：转录因子域，真菌，EBI：Zn（2）-C6真菌型DNA结合域超家族)

生物过程		  
手动管理 * 细胞对药物的反应(进口)
* 细胞对外来刺激的反应(进口)
* 细胞内受体信号通路(进口)
* RNA聚合酶II对转录的正向调节(IGI公司具有酿酒酵母:PDR1（PDR1）,ISA公司具有酿酒酵母:PDR1（PDR1）,进口)
* RNA聚合酶II对转录的调节(进口)
* 药物反应(国际开发协会)
计算型 * DNA模板化转录(国际能源署使用EBI：转录因子域，真菌)
* 细胞对药物反应的正调控(国际能源署具有酿酒酵母:PDR1（PDR1）)
* RNA聚合酶II对转录的正向调节(国际能源署具有酿酒酵母:PDR1（PDR1）)

蜂窝组件		  
高吞吐量 * 真菌生物膜基质(国际开发协会)
计算型 * 细胞溶质(国际能源署具有酿酒酵母:PDR1（PDR1）)
* 核(国际能源署具有酿酒酵母:PDR1（PDR1）)
突变表型 查看全部PDR1（PDR1）表型细节和参考
经典遗传学
激活 * EPA1转录物积累：增加
* 附着力：增加
* 对氟康唑的耐药性：增加
* 毒力：增加

函数增益 * 附着力：降低
* 附着力：增加
* 对唑类药物的耐药性：增加
* 棘白菌素耐药性增加
* 氟康唑耐药性增加
* 泊沙康唑耐药性增加
* 毒力：增加

空 * CDR1-RLUC累积：减少
* CDR2 mRNA积累：减少
* CDR2-RLUC累积：减少
* 对石灰乳白的抗性：降低
* 对环己酰胺的耐药性：降低
* 氟康唑耐药性下降
* 氟胞嘧啶耐药性降低
* 伊曲康唑耐药性下降
* 酮康唑耐药性下降
* 伏立康唑耐药性下降
* 可行的
* 毒力：降低
* 毒力：正常

过度表达 * 罗丹明6G积累：减少

大规模调查
空 * 对氟康唑的耐药性：降低
* 可行的

序列信息 折叠 ChrA_C_glabata_CBS138:62205至65528|J罗兹
上次更新时间 协调: 2022-08-29 |顺序: 2022-08-29

子功能详细信息
相对
协调		染色体
协调		最新更新
协调顺序
5英尺UTR-3254到-158951个到62,2042022-08-292022-08-29
客户尽职调查1到332462,205到65,5282022-08-292022-08-29
3英尺UTR3325到363065,529到65,8342022-08-292022-08-29

检索序列
序列分析工具
地图和显示
外部链接 CGOB公司|FungiDB公司|GenBank（基因银行）(1,2)|基因水平|InterPro公司(1,2)|快速GO|瑞士保护银行|TrEMBL公司
主要CGDID CAL0126583号
其他信息PDR1（PDR1）
轨迹历史基因/序列资源
LOCUS总结注释PDR1（PDR1）（上次更新时间：2010年10月20日）
推断：类似于AA序列：UniProtKB:P12383
注意：类似于uniprot | P12383酵母菌属酿酒YGL013c PDR1转录因子
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南PDR1（PDR1）]
1)蔡海飞，等人。(2006)光滑念珠菌PDR1是一种多效性耐药网络的转录调节因子，在临床分离株和小突变体中介导唑类药物耐药。抗菌剂Chemother50(4):1384-92
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  
2)克里莫娃N，等人。(2014)人类真菌病原光滑念珠菌中一个转录调节因子家族锌簇蛋白的表型分析。G3（贝塞斯达）4（5）：931-40
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3)徐Z，等人。(2021)光滑念珠菌的从头基因组组装揭示了细胞壁蛋白补体和离散串联重复序列的结构摩尔微生物113:1209-1224
CGD论文录入  Pubmed条目  Web增补  数据  
4)塔库尔JK，等人。(2008)一种调节真菌多药耐药性的核受体样途径。自然452(7187):604-9
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5)Vermitsky博士，等人。(2006)Pdr1调节光滑念珠菌的多药耐药性：基因破坏和全基因组表达研究。摩尔微生物61（3）：704-22
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6)蔡海飞，等人。(2010)光滑念珠菌口咽分离物中唑类耐药机制的微阵列和分子分析。抗菌剂Chemother54(8):3308-17
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  数据  
7）Paul S，等人。(2011)光滑念珠菌CgPdr1转录因子的调控。真核细胞10(2):187-97
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  
8)捕获KE，等人。(2011)光滑念珠菌Pdr1调节子的全基因组表达谱分析。真核细胞10(3):373-83
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  数据  

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