白色念珠菌 MCM1/C7_00890C型总结

上次策划时间：2020-10-19
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总结
轨迹历史 文学 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
MCM1型 基本信息[查看参考]
标准名称 MCM1型1
系统名称，参考菌株 C7_00890C_A号(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或19.7025
别名 IPF2363.1防护等级2，轮廓4-3091_0013三，轮廓4-3091_0014三，或6.79514，CA52092，CaJ7.0107号5，CaO19.70256，CaO19_70256，CaJ7_01076或19.7025、C7_00890C_B、C7~00890C
功能类型 ORF，已验证
描述 转录因子；菌丝生长调节剂；可以与Wor1p合作；规范和非规范结合位点；MADS域DNA-结合基序；类似于酿酒酵母Mcm1p；白色细胞比不透明细胞表达更高；5'-UTR内含子(1,7,8,9,10)
文学
Allele名称 C7_00890C_B
等位基因变异 特征无等位基因变异
CUG密码 C7_00890C_A:1号
C7_00890C_B:1号
其他菌株使用的系统名称 CAWG_05447号(白色念珠菌WO-1)
中的同源基因念珠菌物种 杜氏梭菌CD36正交测井：抄送36_70830
金黄色葡萄球菌B8441正交测井：B9J08_003278
副psilosis梭菌CDC317正交测井：CPAR2_301420号
光滑梭菌CBS138正交测井：CAGL0F06237克
查看正交簇：19个基因中的19个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种的正态分布 酿酒酵母(MCM1型)
非CGD物种中的最佳点击 A.鸟巢(毫微安) ;N.克拉萨(NCU07430型) ;S.pombe公司(SPAC11E3.06系列)
J罗兹

JBrowse用于特性C7_00890C_A

GO注释 查看全部MCM1型GO证据和参考

分子功能		  
手动管理 * DNA结合(国际开发协会)
* DNA结合转录因子活性(国际空间站)
计算型 * DNA结合(国际能源署使用EBI：转录因子，MADS盒，EBI：转录因子，MADS-box超家族)
* DNA复制起源结合(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* DNA结合转录激活物活性，RNA聚合酶Ⅱ特异性(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* DNA结合转录因子活性，RNA聚合酶Ⅱ特异性(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* DNA结合转录抑制活性，RNA聚合酶Ⅱ特异性(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* RNA聚合酶Ⅱ顺调控区序列特异性DNA结合(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* RNA聚合酶II顺调控区序列特异性DNA结合，弯曲(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA-结合转录因子结合(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* 顺调控区序列特异性DNA结合(国际能源署使用EBI：MADS SRF类)
* 蛋白质二聚活性(国际能源署使用EBI：转录因子，MADS-box，EBI：转录因子，MADS-box超家族)

生物过程		  
手动管理 * 丝状生长(进口)
* 单细胞生物种群的丝状生长(进口)
* RNA聚合酶II启动子转录的正调控对假菌丝生长的正调控(进口,IGI公司)
* 假菌丝生长的调控(进口,IGI公司)
* RNA聚合酶II对转录的调节(国际空间站)
高吞吐量 * DNA模板转录的调控(国际空间站)
计算型 * RNA聚合酶II对转录的负调控(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* RNA聚合酶II对转录的正向调节(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* 交配式开关的调节(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)

蜂窝组件		  
手动管理 * 染色质(国际开发协会)
计算型 * 染色质(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* 细胞溶质(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
* 核(国际能源署具有酿酒酵母:MCM1型)
突变表型 查看全部MCM1型表型细节和参考
经典遗传学
纯合零 * 不可侵犯的

过度表达 * 絮凝：增加
* 菌丝生长：增加

可压制的 * 丝状生长：异常

大规模调查
杂合性缺失 * 侵入性生长：减少

纯合零 * 生物膜形成：正常
* 可行的

空 * 不可侵犯的

序列信息 折叠 Ca22chr7A_C_albicans_SC5314:188811至188023|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 协调: 2014-06-24 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
协调		染色体
协调		最新更新
协调顺序
光盘1到789188,811到188023年2014-06-242014-06-24

检索序列
序列分析工具
地图和显示器
小巷位置
艾伦C7_00890C_B 折叠		 Ca22chr7B_C_albicans_SC5314:188810至188022|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 协调: 2014-06-24 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
协调		染色体
协调		最新更新
协调顺序
光盘1到789188,810到188,0222014-06-242014-06-24

外部链接 生物网格|CGOB公司|Entrez基因(1,2) |真菌原木|FungiDB公司|GenBank（基因银行）(1,2,三,4,5) |非周期表达|踏板|PhylomeDB公司|瑞士保护银行|TrEMBL公司
主要CGDID 加利福尼亚州0000194125
其他信息MCM1型
基因/序列资源
LOCUS总结注释MCM1型（上次更新时间：2011-06-10）
  • Mcm1p是一种MADS盒家族转录因子，调节白色念珠菌(1)
  • 类似酿酒酵母 千立方厘米它参与细胞类型特异性转录和信息素反应，通过额外的转录因子招募到目标启动子
  • 它是白色念珠菌(1)
  • Mcm1p转录物水平没有显著变化，与培养基、细胞类型或温度无关，并对自动调节反馈机制作出反应；人们认为千立方厘米活性受翻译后修饰的调节(1)
  • 该基因的过度表达和抑制导致菌丝生长的诱导(1)
  • 可以与Wor1p公司;千立方厘米结合调节器Wor1p公司许多基因在与人类宿主适应相关的过程中发挥作用，包括白色-白色表观遗传开关(10)
  • 在与转录因子的复合物中，阿氏1磅，Ahr1p-Mcm1p复合物直接激活粘附基因，如ALS1（ALS1）,ALS2型,ALS4型和CSH1型(11)
  • 它有较高水平的白相表达和较低水平的乳相表达(7)
  • 在其5'-UTR中含有一个未标记的内含子(9)
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南MCM1型]
1)Rottmann M，等人。(2003)在酿酒酵母中进行的一次筛选鉴定出CaMCM1，这是白色念珠菌中一个对形态发生至关重要的重要基因。摩尔微生物47(4):943-59
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  
2)CandidaDB公司
CGD论文录入  
3)伯曼J（2005）将程序集4中的ORF映射到程序集19中的ORFs。
CGD论文录入  
4)CGD（2005）orf6和orf19预测蛋白质产物的CGD比较。
CGD论文录入  
5)奇瓦纳H，等人。(2005)白色念珠菌7号染色体的序列整理和基因定位以及与酿酒酵母基因组的同源性分析。遗传学170(4):1525-37
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6)Maglott D公司，等人。(2007)Entrez Gene：NCBI以基因为中心的信息。核酸研究35（数据库问题）：D26-31
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  参考LINKOUT  参考LINKOUT  参考LINKOUT  参考LINKOUT  
7)Srikantha T，等人。(2001)组蛋白去乙酰化酶基因HDA1和RPD3在白色念珠菌高频表型转换的调节中起着不同的作用。J细菌183(15):4614-25
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  
8)Nobile CJ和Mitchell AP（2005）白念珠菌转录因子Bcr1p对细胞表面基因和生物膜形成的调节。当前生物15(12):1150-5
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  Web增补  数据  
9)米特罗维奇质量管理，等人。(2007)计算和实验方法使致病性白念珠菌中已知内含子的数量增加了一倍。基因组研究17(4):492-502
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  Web增补  数据  
10)Tuch BB、，等人。(2008)真菌组合基因调控的进化。公共科学图书馆生物学6（2）：e38
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  参考LINKOUT  参考LINKOUT  Web增补  Web增补  Web增补  Web增补  Web增补  Web增补  Web增补  Web增补  Web增补  Web增补  Web增补  数据  
11)如C所示，等人。(2011)锌簇转录因子Ahr1p指导Mcm1p对白色念珠菌粘附的调节。摩尔微生物79(4):940-53
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