白色念珠菌 PLB1/C6_01990瓦总结

上次策划时间:2024-07-08
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总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
产品生命周期1 基本信息[查看参考资料]
标准名称 产品生命周期11,2
系统名称,参考菌株 C6_01990W_A(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或19.689
别名 或19.8307,IPF26625.1,IPF9584.2,轮廓4-1818_00034,或6.36905,CA1975年,CaO19.6896或19.689、C6_01990W_B、C6_01999W
要素类型 ORF,已验证
描述 磷脂酶B;小鼠系统感染中的宿主细胞渗透和毒力;Hog1诱导;信号序列、N-糖基化和Tyr磷酸化位点;耐氟康唑菌株诱导;大鼠导管生物膜被抑制(1,2,7,8,9)
文学类
名称说明 磷酸脂肪酶B
Allele名称 C6_01990W_B
等位基因变异 等位基因之间的非同义变异
特征起始坐标上游100 bp内等位基因之间的序列变异
CUG密码 C6_01990W_A:2
C6_01990W_B:2个
其他菌株使用的系统名称 CAWG_05168号(白色念珠菌WO-1)
中的同源基因念珠菌物种 副psilosis梭菌CDC317正交测井:CPAR2_601730号
杜氏梭菌CD36正交测井:抄送36_62110
查看正交簇:8个基因中有8个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种中的最佳点击 A.鸟巢(AN7792型) ;N.克拉萨(液化石油气) ;S.pombe公司(SPBC1348.10c型)
J罗兹

JBrowse用于功能C6_01990W_A

GO注释 查看全部产品生命周期1GO证据和参考资料

分子功能
 
手动管理 * 溶血磷脂酶活性(国际开发协会,进口,国际空间站)

生物过程
 
手动管理 * 生物种间相互作用的生物过程(进口)
* 主机中的迁移(进口)
计算型 * 磷脂分解代谢过程(国际能源署使用EBI:溶血磷脂酶,催化域)

蜂窝组件
 
手动管理 * 细胞外区域(国际空间站,国际开发协会)
* 细胞外小泡(国际开发协会)
突变表型 查看全部产品生命周期1表型细节和参考
经典遗传学
杂合性缺失 * 可行的
* 毒力:正常

纯合子缺失 * 附着力:正常
* 生殖管形成:正常
* 与主机/环境的交互:减少
* 两性霉素B耐药性:正常
* 可行的
* 毒力:降低

大规模调查
杂合性缺失 * 可行的

* 可行的

可压制的 * 可行的

序列信息 折叠 Ca22chr6A_C_albicans_SC5314:405913至407730|J罗兹
上次更新时间 协调: 2016-01-21 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
协调
染色体
协调
最新更新
协调顺序
客户尽职调查11818405, 913407,7302016-01-212014-06-24

检索序列
序列分析工具
地图和显示
小巷位置
艾伦C6_01990W_B
折叠
Ca22chr6B_C_albicans_SC5314:405871至407688|J罗兹
上次更新 协调: 2016-01-21 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
协调
染色体
协调
最新更新
协调顺序
客户尽职调查11818405,871407,6882016-01-212014-06-24

外部链接 CGOB公司|Entrez基因(1,2) |真菌原木|FungiDB公司|GenBank(基因银行)(1,2,,4,5,6) |非周期表达|踏板|PhylomeDB公司|瑞士保护协会|TrEMBL公司
主要CGDID 加利福尼亚州0000177213
其他信息产品生命周期1
基因/序列资源
LOCUS总结注释产品生命周期1(上次更新时间:2011-05-11)
  • Plb1p是一种细胞外磷脂酶B;脂解酶;它被认为是一种毒力因子白色念珠菌(1,2.10)
  • 产品生命周期1包含七个潜在的N-糖基化(Asn-X-Ser/Thr)位点和一个潜在的酪氨酸磷酸化位点,Lys-Ser-Asn-Ile-Asp-Val-Ser-Ala-Tyr(残基369-377);糖基磷脂酰肌醇(GPI)附着位点未预测(1,2)
  • 存在于氨基酸末端(残基1-18)的疏水性氨基酸可能作为靶向的信号肽Plb1磅内质网进行加工和分泌(1)
  • 它已被定位到6号染色体(1)
  • 酵母细胞和假菌丝表达较高水平的产品生命周期1mRNA比芽管形成细胞(2)
  • 在各种测试条件下,元组1突变体表达更高水平的产品生命周期1mRNA表明Tup1p型压抑产品生命周期1表达式(2)
  • 空突变体是可行的,没有明显的表型;然而,产品生命周期1是系统性感染小鼠模型中野生型毒力所必需的(1,10)
  • 免疫金电子显微镜研究表明白色念珠菌在宿主组织感染期间,从菌丝顶端分泌这种酶(11)
  • 野生型宿主细胞穿透所需;删除产品生命周期1虽然不影响念珠菌对人内皮细胞或上皮细胞的粘附,但突变体穿透宿主细胞的能力显著降低(1)
  • 猪1表明Hog1p信号转导诱导第1页(7)
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南产品生命周期1]
1)莱迪SD,等。(1998)白念珠菌致病性相关磷脂酶B基因caPLB1的克隆和断裂。生物化学杂志273(40):26078-86
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2)胡佛CI,等。(1998)白色念珠菌磷脂酶B(PLB1)基因的克隆和调控表达。FEMS微生物快报167(2):163-9
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3)CandidaDB公司
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4)伯曼J(2005)将程序集4中的ORF映射到程序集19中的ORFs。
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5)CGD(2005)orf6和orf19预测蛋白质产物的CGD比较。
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8)净JE,等。(2009)体内念珠菌生物膜的时间进程全局基因表达分析。感染性疾病杂志200(2):307-13
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9)Ying S和Chunyang L(2012)白色念珠菌磷脂酶与氟康唑耐药性的关系。真菌55(1):50-5
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10)马萨诸塞州甘努姆(1998)细胞外磷脂酶是致病真菌中的普遍毒力因子。Nihon Ishinkin Gakkai Zasshi尼洪·伊辛金·加凯·扎西39(2):55-9
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11)马萨诸塞州甘努姆(2000)磷脂酶在毒力和真菌发病机制中的潜在作用。临床微生物评论13(1):122-43,目录
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  


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