白色念珠菌 太阳41/C6_00820W总结

上次策划时间:2023-03-06
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总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
太阳41 基本信息[查看参考]
标准名称 太阳411
系统名称,参考菌株 C6_00820W_A(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或19.3642
别名 太阳4号2
或1911124或6.2071,IPF23637.1,IPF14577.2,轮廓4-2119_00024,CA0883,CaO19.36425,CaO19.11124年5或19.3642、C6_00820W_B、C6_000820W
要素类型 ORF,已验证
描述 细胞壁糖苷酶;在生物膜形成和细胞分离中的作用;可能分泌;缺氧,菌丝诱导;卡泊芬净被抑制;调节Efg1、Cph1;O-糖基化,可能为Kex2底物;5'-UTR内含子;蜘蛛生物膜诱导(1,6,7,8,9,10,11,12,13)
文学类
Allele名称 C6_00820W_B
等位基因变异 等位基因之间的非同义变异
特征起始坐标上游100 bp内等位基因之间的序列变异
特征末端坐标下游100 bp内等位基因之间的序列变异
CUG密码 C6_00820W_A:0
C6_00820W_B:0
其他菌株使用的系统名称 CAWG_05277号(白色念珠菌WO-1)
中的同源基因念珠菌物种 C.近矽肺CDC317正交测井:CPAR2_603090/太阳41
金黄色葡萄球菌B8441正交测井:B9J08_005359
杜氏梭菌CD36正交测井:抄送36_60800
光滑梭菌CBS138正交测井:CAGL0J09922g
查看正交簇:18个基因中的18个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种的正态分布 S.pombe公司(SPAC1002.13c系列) ;酿酒酵母(太阳4)
非CGD物种中的最佳点击 A.鸟巢(太阳神) ;N.克拉萨(NCU02668型)
J罗兹

功能C6_00820W_A的JBrowse

GO注释 查看全部太阳41GO证据和参考

分子功能
 
手动管理 * 葡聚糖内切-1,3-β-D-葡萄糖苷酶活性(国际开发协会)

生物过程
 
手动管理 * 共生体对宿主的粘附(进口)
* 生物种间相互作用的生物过程(进口)
* 细胞对生物刺激的反应(进口)
* 丝状生长(进口)
* 生物刺激下单细胞生物种群的丝状生长(进口)
* 真菌型细胞壁组织(IGI公司具有白色念珠菌:SIM1系列)
* 胞质分裂后的隔膜消化(进口)
* 宿主生物内或上单种生物膜的形成(进口)
* 无生命基质上单种生物膜的形成(进口)
计算型 * 麦角甾醇生物合成过程(区域协调机构)
* 真菌型细胞壁组织或生物发生(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC1002.13c系列)

蜂窝组件
 
手动管理 * 细胞外区域(国际开发协会)
* 细胞外小泡(国际开发协会)
* 真菌生物膜基质(国际开发协会)
* 真菌型细胞壁(国际空间站)
高吞吐量 * 电池表面(国际开发协会)
* 细胞外区域(国际开发协会)
计算型 * 细胞芽疤痕(国际能源署具有酿酒酵母:太阳4号)
* 真菌型细胞壁(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC1002.13c系列,酿酒酵母:太阳4号)
突变表型 查看全部太阳41表型细节和参考
经典遗传学
纯合零 * 附着力:降低
* 生物膜形成:异常
* 生物膜形成:减少
* 单元格大小:增加
* 胞质分裂:缺失
* 芽管形成:异常
* 菌丝生长:减少
* 刚果红抗性下降
* 卡泊芬净耐药性下降
* 对石灰乳白色的抗性:正常
* 静止期存活率下降
* 可行的
* 毒力:降低

大规模调查
杂合性缺失 * 可行的

* 可行的

序列信息 折叠 Ca22chr6A_C_albicans_SC5314:158273至159529|J罗兹
上次更新时间 坐标: 2016-01-21 |序列: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
坐标
染色体
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最新更新
坐标序列
客户尽职调查11257158,273159,5292016-01-212014-06-24

检索序列
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地图和显示
小巷位置
艾伦C6_00820W_B
折叠
Ca22chr6B_C_albicans_SC5314:158264至159520|J罗兹
上次更新时间 坐标: 2016-01-21 |序列: 2014-06-24

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相对
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客户尽职调查11257158,264159,5202016-01-212014-06-24

外部链接 生物网格|CGOB公司|Entrez基因(1,2) |真菌原木|FungiDB公司|GenBank(基因银行)(1,2,,4,5,6) |非周期表达|踏板|PhylomeDB公司|瑞士保护银行|转录模块
主要CGDID CAL0000175157
其他信息太阳41
基因/序列资源
LOCUS总结注释太阳41(上次更新时间:2011-05-09)
  • Sun41p(也称为Sun4p)是一种假定的细胞壁糖苷酶,在粘附和生物膜形成中发挥作用(10)
  • 它的C末端有一个预测的分泌信号肽和一个保守的SUN结构域(11)
  • 它的启动子中含有9个被认为与APSES域转录因子结合的E-box,设备1p(1)
  • 它在5'非翻译区有一个预测的内含子(9)
  • 预测的基底Kex2p公司蛋白酶(6)
  • Sun41p在酵母和菌丝生长的细胞培养基中分泌(10)
  • 突变体在生物膜形成方面表现出缺陷,在Caco-2细胞单层上的粘附性降低,并且不能在细胞分离和正常菌丝伸长所需的固体培养基17905924上形成菌丝(11)
  • 周日41突变体对细胞壁扰动剂刚果红敏感,但对钙氟白不敏感(10)
  • 它是一种白细胞特异性基因,在白色但不透明的细胞中强烈上调(14)
  • 白色念珠菌细胞在缺氧条件下生长(8)
  • 接触抗真菌药物caspofungin后,它会受到抑制(7)
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南太阳41]
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