太阳41 基本信息[查看参考] |
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系统名称,参考菌株 | | C6_00820W_A(白色念珠菌SC5314) |
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别名 | | 太阳4号2 或1911124或6.2071三,IPF23637.1三,IPF14577.2三,轮廓4-2119_00024,CA0883三,CaO19.36425,CaO19.11124年5或19.3642、C6_00820W_B、C6_000820W |
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描述 | | 细胞壁糖苷酶;在生物膜形成和细胞分离中的作用;可能分泌;缺氧,菌丝诱导;卡泊芬净被抑制;调节Efg1、Cph1;O-糖基化,可能为Kex2底物;5'-UTR内含子;蜘蛛生物膜诱导(1,6,7,8,9,10,11,12,13) |
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等位基因变异 | | 等位基因之间的非同义变异 特征起始坐标上游100 bp内等位基因之间的序列变异 特征末端坐标下游100 bp内等位基因之间的序列变异 |
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CUG密码 | | C6_00820W_A:0 C6_00820W_B:0 |
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其他菌株使用的系统名称 | | CAWG_05277号(白色念珠菌WO-1) |
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J罗兹 | |
功能C6_00820W_A的JBrowse
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序列信息 | | Ca22chr6A_C_albicans_SC5314:158273至159529|J罗兹 | 上次更新时间 | | 坐标: 2016-01-21 |序列: 2014-06-24 | 子功能详细信息 | | | | 相对 坐标 | | 染色体 坐标 | | 最新更新 |
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坐标 | | 序列 | 客户尽职调查 | | 1 | 到 | 1257 | | 158,273 | 到 | 159,529 | | 2016-01-21 | | 2014-06-24 |
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序列信息 | | Ca22chr6A_C_albicans_SC5314:158273至159529|J罗兹 |
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小巷位置 艾伦C6_00820W_B | | Ca22chr6B_C_albicans_SC5314:158264至159520|J罗兹 | 上次更新时间 | | 坐标: 2016-01-21 |序列: 2014-06-24 | 子功能详细信息 | | | | 相对 坐标 | | 染色体 坐标 | | 最新更新 |
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坐标 | | 序列 | 客户尽职调查 | | 1 | 到 | 1257 | | 158,264 | 到 | 159,520 | | 2016-01-21 | | 2014-06-24 |
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小巷位置 艾伦C6_00820W_B | | 钙22chr6B_C_碱性钙SC5314:158264至159520|J罗兹 |
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LOCUS总结注释太阳41(上次更新时间:2011-05-09) |
- Sun41p(也称为Sun4p)是一种假定的细胞壁糖苷酶,在粘附和生物膜形成中发挥作用(10)
- 它的C末端有一个预测的分泌信号肽和一个保守的SUN结构域(11)
- 它的启动子中含有9个被认为与APSES域转录因子结合的E-box,设备1p(1)
- 它在5'非翻译区有一个预测的内含子(9)
- 预测的基底Kex2p公司蛋白酶(6)
- Sun41p在酵母和菌丝生长的细胞培养基中分泌(10)
- 突变体在生物膜形成方面表现出缺陷,在Caco-2细胞单层上的粘附性降低,并且不能在细胞分离和正常菌丝伸长所需的固体培养基17905924上形成菌丝(11)
- 周日41突变体对细胞壁扰动剂刚果红敏感,但对钙氟白不敏感(10)
- 它是一种白细胞特异性基因,在白色但不透明的细胞中强烈上调(14)
- 当白色念珠菌细胞在缺氧条件下生长(8)
- 接触抗真菌药物caspofungin后,它会受到抑制(7)
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1) | 宋·K,等。(2003年)DNA微阵列显示,EFG1是白色念珠菌细胞壁动力学的主要调节因子。摩尔微生物47(1):89-102 | 2) | 桑多夫斯基-洛西卡H,等。(2006)HEp2上皮细胞感染后白色念珠菌的基因转录研究。Med Mycol公司44(4):329-34 | 3) | 坎迪达数据库 | 4) | 伯曼J(2005)将程序集4中的ORF映射到程序集19中的ORFs。 | 5) | 马格洛特D,等。(2007)Entrez Gene:NCBI以基因为中心的信息。核酸研究35(数据库问题):D26-31 | 6) | 纽波特G,等。(2003年)灭活Kex2p可降低白色念珠菌的毒力。生物化学杂志278(3):1713-20 | 7) | 刘TT,等。(2005)白色念珠菌对唑类、多烯类、棘白菌素和嘧啶类抗真菌药物反应的基因组表达谱。抗菌剂Chemother49(6):2226-36 | 8) | 塞蒂亚迪ER,等。(2006)白色念珠菌对缺氧的转录反应:氧感应和Efg1p调节网络的联系。分子生物学杂志361(3):399-411 | 9) | 米特罗维奇质量管理,等。(2007)计算和实验方法使致病性白念珠菌中已知内含子的数量增加了一倍。基因组研究17(4):492-502 | 10) | 希勒·E,等。(2007)白色念珠菌Sun41p是一种假定的糖苷酶,参与形态发生、细胞壁生物发生和生物膜形成。真核细胞6(11):2056-65 | 11) | 菲隆A,等。(2007)SUN41和SUN42基因对白色念珠菌的细胞分离至关重要。摩尔微生物66(5):1256-75 | 12) | Sorgo股份公司,等。(2011)氟康唑对临床真菌白色念珠菌分泌体、壁蛋白组和壁完整性的影响。真核细胞10(8):1071-81 | 13) | 贵族CJ,等。(2012)最近进化的转录网络控制白色念珠菌生物膜的发育。单元格148(1-2):126-38 | 14) | 萨赫尼N,等。(2009)白细胞中信息素选择性上调的基因参与了白念珠菌生物膜的形成。公共科学图书馆-病理学5(10):e1000601 |
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