白色念珠菌 RAD52/C6_00510C型总结

上次策划时间：2021-03-09
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总结

RAD52型基本信息[查看参考]

标准名称

RAD52型¹

系统名称，参考菌株

C6_00510C_A号(白色念珠菌SC5314)

组件19/21标识符

或19.4208

别名

或19.11684，IPF23060.1²，防护等级7832.2²，轮廓4-2854_0016^三，或6.5013⁴，约2927年²，CaO19.4208⁵，CaO19.11684年⁵或19.4208、C6_00510C_B、C6_005 10C

功能类型

ORF，已验证

描述

需要同源DNA重组、修复紫外线或MMS损伤的DNA、端粒长度、紫外线诱导的LOH；本构表达式，MMS诱导；弱互补酿酒酵母rad52突变体；增长缓慢，增加了白-不透明切换(1,6,7)

文学

Allele名称

C6_00510C_B

等位基因变异

等位基因之间的非同义变异

CUG密码

C6_00510C_A:1
C6_00510C_B:1

其他菌株使用的系统名称

CAWG_05307号(白色念珠菌WO-1)

中的同源基因念珠菌物种

副psilosis梭菌CDC317正交测井：CPAR2_603630
金黄色葡萄球菌B8441正交测井：B9J08_000514
杜氏梭菌CD36正交测井：抄送36_60440
光滑梭菌CBS138正交测井：CAGL0G07381克
查看正交簇：19个基因中的19个念珠菌-相关物种/菌株

非CGD物种的正态分布

S.pombe公司(SPAC30D11.10系列) ;酿酒酵母(RAD52型)

非CGD物种中的最佳点击

A.鸟巢(无线电数据通信) ;N.克拉萨(缪斯-11)

J罗兹

JBrowse用于功能C6_00510C_A

GO注释		查看全部雷达52GO证据和参考
分子功能
手动管理		DNA结合(国际空间站)
计算型		DNA末端结合(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列) DNA链交换活性(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型) DNA/DNA退火活性(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型) 双链DNA结合(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列) 单链DNA结合(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列)
生物过程
手动管理		DNA修复(进口) 生物种间相互作用的生物过程(进口,IGI公司具有白色念珠菌:图4) 细胞对紫外线的反应(进口) 细胞对药物的反应(进口) 细胞对电离辐射的反应(进口) 细胞对氧化应激的反应(进口) 同源重组修复双链断裂(进口) 丝状生长(进口) 单细胞生物种群的丝状生长(进口) 有丝分裂重组(进口) 单细胞生物种群丝状生长的负调控(进口) 表型转换(进口) 端粒维持(进口)
计算型		DNA扩增(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型) DNA重组酶组装(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型) 通过防波堤诱导复制修复双绞线断裂(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型) 同源重组修复双链断裂(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列,酿酒酵母:RAD52型) 通过单线退火修复双绞线断裂(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型) 交配型基因座的基因转化(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列) 组蛋白乙酰化(远程控制卡) 配对式开关(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列) 减数分裂联合分子形成(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型) 线粒体DNA修复(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型) 有丝分裂重组依赖性复制分叉处理(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列) 复制后修复(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型) 蛋白酶体介导的泛素依赖性蛋白质分解代谢过程(远程控制卡) 复制分叉处理(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列) 暂停的复制分叉定位到核外围(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列) 端粒维持(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列) 通过重组维持端粒(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列,酿酒酵母:RAD52型) 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程(远程控制卡)
蜂窝组件
计算型		染色质(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列) 核染色体(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型) 核(国际能源署具有酿酒酵母:RAD52型,S.pombe公司:SPAC30D11.10系列) 双绞线断裂位置(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC30D11.10系列)

突变表型		查看全部RAD52型表型细节和参考
经典遗传学
杂合性缺失		突变频率：降低甲基磺酸甲酯抗性下降可行的毒力：正常
纯合零		抗紫外线：降低染色体/质粒维护：异常丝状生长：异常有丝分裂重组：减少突变频率：降低氧化应激抵抗力下降表型转换：增加博莱霉素耐药性下降喜树碱耐药性下降对甲基磺酸乙酯的抗性降低氟康唑耐药性下降甲基磺酸甲酯抗性下降端粒长度：增加营养生长：下降率可行的毒力：无
过度表达		突变频率：增加可行的
可压制的		抗紫外线：降低甲基磺酸甲酯抗性下降
大规模调查
杂合性缺失		可行的
空		不可侵犯的

序列信息

Ca22chr6A_C_albicans_SC5314:97367至95673|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。

上次更新时间

协调: 2016-01-21 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息

		相对协调				染色体协调				最新更新
		相对协调				染色体协调				协调		顺序
光盘		1	到	1695		97,367	到	95,673		2016-01-21		2014-06-24

检索序列
序列分析工具
地图和显示器

小巷位置
艾伦C6_00510C_B

Ca22chr6B_C_albicans_SC5314:97367至95673|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。

上次更新时间

协调: 2016-01-21 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息

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光盘		1	到	1695		97,367	到	95,673		2016-01-21		2014-06-24

外部链接

主要CGDID

加利福尼亚州0000180590

其他信息RAD52型

基因/序列资源

本页引用的参考文献[查看的完整文献指南RAD52型]

1)	*T市，等人。(2004)白色念珠菌中的同源重组：CaRad52p在DNA修复、线性DNA片段整合和端粒长度中的作用。摩尔微生物*53(4):1177-94
2)	CandidaDB公司
3)	伯曼J（2005）将程序集4中的ORF映射到程序集19中的ORFs。
4)	CGD（2005）orf6和orf19预测蛋白质产物的CGD比较。
5)	*Maglott D公司，等人。(2007)Entrez Gene：NCBI以基因为中心的信息。核酸研究*35（数据库问题）：D26-31
6)	*高木Y，等人。(2008)紫外线照射导致白色念珠菌杂合性缺失。应用微生物生物技术*77(5):1073-82
7)	Alby K和Bennett RJ（2009）应激诱导的白色念珠菌表型转换。分子生物学细胞20（14）：3178-91

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引用CGD，请使用以下内容参考：Skrzypek MS、Binkley J、Binkley G、Miyasato SR、Simison M、Sherlock G（2017）。念珠菌基因组数据库（CGD）：纳入组装22、系统标识符和高通量测序数据可视化。核酸研究 45（D1）；D592-D596；看见如何引用CGD。

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