白色念珠菌 MRR2/C3_07860C总结

上次策划时间:2023-10-30
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总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
2号机房 基本信息[查看参考]
标准名称 2号机房1
系统名称,参考菌株 C3_07860C_A(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或19.6182
别名 ZCF34型2,
IPF3443.1型4,轮廓4-3079_00165,或6.54036,约3201年4,CaO19.61827,IPF3444.3f4或19.6182、C3_07860C_B、C3_078 60C
要素类型 ORF,已验证
描述 Zn(II)2Cys6转录因子通过调控CDR1表达参与多药耐药的调控;突变体显示小鼠肾脏定植减少;酵母细胞粘附到硅酮基底所需(1,2,,8,9,10,11,12)
文学类
名称说明 多药耐药调节剂1
Allele名称 C3_07860C_B
等位基因变异 特征无等位基因变异
CUG密码 C3_07860C_A:4个
C3_07860C_B:4
其他菌株使用的系统名称 CAWG_03092号(白色念珠菌WO-1)
中的同源基因念珠菌物种 杜氏梭菌CD36正交测井:抄送36_87720
C.近矽肺CDC317正交测井:CPAR2_807820
查看正交簇:14个基因中的14个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种中的最佳点击 A.鸟巢(AN10659型) ;N.克拉萨(NCU16491型) ;S.pombe公司(SPBC16G5.17型)
J罗兹

JBrowse用于功能C3_07860C_A

GO注释 查看全部2号机房GO证据和参考

分子功能
 
手动管理 * DNA结合转录因子活性(国际标准化组织具有酿酒酵母:RDR1号机组)
高吞吐量 * DNA结合转录因子活性(国际空间站)
计算型 * DNA结合(国际能源署使用EBI:转录因子域,真菌)
* DNA结合转录因子活性,RNA聚合酶Ⅱ特异性(国际能源署使用EBI:Zn(2)Cys(6)真菌型DNA结合域,EBI:Zn(2)-C6真菌型DNA结合域超家族)
* 锌离子结合(国际能源署使用EBI:Zn(2)Cys(6)真菌型DNA结合域,EBI:转录因子域,真菌,EBI:Zn(2)-C6真菌型DNA结合域超家族)

生物过程
 
手动管理 * 与宿主相互作用的生物过程(进口)
* 细胞对药物的反应(进口)
* 单种生物膜形成中细胞粘附的正调控(进口)
* 细胞-基质粘附的正调控(进口)
* 细胞对药物反应的正向调节(进口)
* DNA模板转录的调控(国际标准化组织具有酿酒酵母:RDR1号机组)
* RNA聚合酶II对转录的调节(进口)
* 无生命基质上单种生物膜的形成(进口)
高吞吐量 * DNA模板转录的调控(国际空间站)
计算型 * DNA模板化转录(国际能源署使用EBI:转录因子域,真菌)
* 共生体对宿主的粘附(区域协调机构)
* 细胞粘附(区域协调机构)
* 单细胞生物群体对生物刺激的丝状生长正调控(区域协调机构)

蜂窝组件
 
手动管理 * 细胞成分未知(ND(无损检测))
突变表型 查看全部2号机房表型细节和参考
经典遗传学
杂合性缺失 * 克霉唑耐药性下降

纯合零 * 附着力:降低
* 静止期存活率下降
* 可行的

大规模调查
纯合零 * 生物膜形成:正常
* 菌落外观:异常
* 竞技体能:正常
* 氟康唑耐药性下降
* 营养生长:正常速率
* 可行的

* 可行的

可压制的 * 营养生长:正常速率
* 可行的

序列信息 折叠 Ca22chr3A_C_albicans_SC5314:1780547至1778415|J罗兹
注:该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 坐标: 2016-06-22 |序列:2016年6月22日

子功能详细信息
相对
坐标
染色体
坐标
最新更新
坐标序列
客户尽职调查121331,780,5471,778,4152016-06-222016-06-22

检索序列
序列分析工具
地图和显示
小巷位置
巷C3_07860C_B
折叠
Ca22chr3B_C_albicans_SC5314:1780518至1778386|J罗兹
注:该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 坐标: 2016-06-22 |序列: 2016-06-22

子功能详细信息
相对
坐标
染色体
坐标
最新更新
坐标序列
客户尽职调查121331,780,5181,778,3862016-06-222016-06-22

外部链接 生物网格|CGOB公司|Entrez基因|真菌原木|FungiDB公司|GenBank(基因银行)(1,2,) |非周期表达|踏板|PhylomeDB公司|瑞士保护银行|TrEMBL公司
主要CGDID 加利福尼亚州0000180700
其他信息2号机房
基因/序列资源
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南2号机房]
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