白色念珠菌 工程2/C3_05170W总结

上次策划时间：2024-04-22
请参阅文献指南最新出版物.

帮助

总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
工作任务2 基本信息[查看参考]
标准名称 世界21
系统名称，参考菌株 C3_05170W_A(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或1992年15月
别名 或19.13413，IPF21214.12，IPF4835.12，轮廓4-2837_0008三，或6.90454，CA60712，CaO19.134135，CaO19.59925，IPF48352或19.5992、C3_05170W_B、C3_051270W
要素类型 ORF，已验证
描述 锌（II）2Cys6转录因子；防白开关调节器；需要保持不透明状态；Hap43诱导的(1，6)
文学类
名称描述 White-Opaque调节器1
Allele名称 C3_05170W_B
等位基因变异 特征无等位基因变异
CUG密码 C3_05170W_A:1
C3_05170W_B:1个
中的同源基因念珠菌物种 金黄色葡萄球菌B8441正交对数：B9J08_002136
C.近矽肺CDC317正交测井：CPAR2_405400
杜氏梭菌CD36正交测井：抄送36_85150
查看正交簇：16个基因中有16个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种中的最佳点击 A.鸟巢(AN5533型) ;N.克拉萨(NCU05294型) ;S.pombe公司(SPBC15D4.02型)
J罗兹

JBrowse用于功能C3_05170W_A

GO注释 查看全部工作任务2GO证据和参考

分子功能		  
计算型 * DNA结合转录因子活性，RNA聚合酶Ⅱ特异性(国际能源署使用EBI：Zn（2）Cys（6）真菌型DNA结合域，EBI：Zn（2）-C6真菌型DNA结合结构域超家族)
* 锌离子结合(国际能源署使用EBI：Zn（2）Cys（6）真菌型DNA结合域，EBI：Zn（2）-C6真菌型DNA结合域超家族)

生物过程		  
手动管理 * 共生相互作用中的生物过程(进口)
* 丝状生长(进口)
* 单细胞生物作为附着细胞的线生长(进口)
* 配合(进口)
* 以附着细胞为线索的单细胞生物生长的负调控(进口)
* 表型转换(进口)
* 表型转换的正调控(进口)
计算型 * DNA复制启动(区域协调机构)
* 染色质重塑(区域协调机构)
* 组蛋白乙酰化(区域协调机构)
* DNA模板转录的调控(国际能源署使用EBI：Zn（2）Cys（6）真菌型DNA结合域，EBI：Zn（2）-C6真菌型DNA结合域超家族)

蜂窝组件		  
手动管理 * 细胞成分未知(ND（无损检测）)
已注销名称 ZCF33型
突变表型 查看全部工作任务2表型细节和参考
经典遗传学
纯合零 * 单元格大小：减小
* 竞技体能：提高
* 侵袭性生长：增加
* 表型转换：异常
* 表型转换：缺失
* 可行的

大规模调查
纯合零 * 菌落外观：异常
* 竞技体能：正常
* 营养生长：正常速率
* 可行的

空 * 可行的

可压制的 * 营养生长：正常速率
* 可行的

序列信息 折叠 Ca22chr3A_C_albicans_SC5314:1118725至1120065|J罗兹
上次更新时间 协调: 2016-06-22 |顺序: 2016-06-22

子功能详细信息
相对
协调		染色体
协调		最新更新
协调顺序
客户尽职调查1到13411,118,725到1,120,0652016-06-222016-06-22

检索序列
序列分析工具
地图和显示
小巷位置
Allele C3_05170W_B巷 折叠		 Ca22chr3B_C_albicans_SC5314:1118703至1120043|J罗兹
上次更新时间 协调: 2016-06-22 |顺序: 2016-06-22

子功能详细信息
相对
协调		染色体
协调		最新更新
协调顺序
客户尽职调查1到13411,118,703到1,120,0432016-06-222016-06-22

外部链接 CGOB公司|Entrez基因(1，2) |真菌原木|FungiDB公司|GenBank（基因银行）(1，2，三，4，5，6) |非周期表达式|踏板|PhylomeDB公司|瑞士保护银行|转录模块
主要CGDID 加利福尼亚州0000177394
其他信息工作任务2
基因/序列资源
LOCUS总结注释工作任务2（上次更新时间：2011-06-21）
  • 世界2编码一个Zn（II）2Cys6结构域转录调控子的白-不透开关(1，7)
  • 它起着关键的作用，即白-不透交换；它是保持不透明状态所必需的(1)
  • 染色质免疫沉淀法，Wor1p公司，一个白-白转换的主调节器，被发现绑定工作任务2(1)
  • 该基因由CCAAT结合因子依赖的转录调控因子诱导，Hap43p型（Cap2p），在低铁条件下(6)
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南工作任务2]
1)佐丹雷，等。(2007)连锁转录反馈环控制白色念珠菌的白色-白色转换。公共科学图书馆生物5（10）：e256
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  数据  
2)CandidaDB公司
CGD论文录入  
3)伯曼J（2005）将程序集4中的ORF映射到程序集19中的ORFs。
CGD论文录入  
4)CGD（2005）orf6和orf19预测蛋白质产物的CGD比较。
CGD论文录入  
5)马格洛特D，等。(2007)Entrez Gene：NCBI以基因为中心的信息。核酸研究35（数据库问题）：D26-31
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  参考LINKOUT  参考LINKOUT  参考LINKOUT  参考LINKOUT  
6)辛格RP，等。（2011年）Cap2-HAP复合物是一种重要的转录调控因子，在白念珠菌铁稳态调节中具有双重但相反的作用。生物化学杂志286(28):25154-70
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  数据  
7)迈卡斯S，等。(2005)白色念珠菌Zn（II）（2）C（6）双核簇DNA结合域转录因子的电子分析。Comp Funct基因组学6(7-8):345-56
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  参考LINKOUT  参考LINKOUT  

返回CGD
向CGD策展人发送消息