白色念珠菌 SNF5/C3_04290C总结

上次策划时间：2024-05-25
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总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
SNF5系列 基本信息[查看参考]
标准名称 SNF5系列1
系统名称，参考菌株 C3_04290C_A号(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或19.5871
别名 或19.13292或19.13293或6.7742，IPF19844.2标准三，IPF21275.1三，IPF14343.2三，IPF14342.2三，轮廓4-3084_00094，轮廓4-3084_00104，轮廓4-3084_00114，或6.91662，或6.91652，CA6165三，CA6164三，或19.5872，SNF5.3f三，或19.5871，C3_04290C_B，C3_04280C
要素类型 ORF，已验证
描述 参与转录调控的SWI/SNF染色质重塑复合物亚单位；突变体在硅酮粘附、生物膜形成、菌丝形态发生、细胞壁缺陷等方面存在缺陷；酵母形态生长过程中细胞聚集增加(1)
文学类
Allele名称 C3_04290C_B
等位基因变异 等位基因之间的非同义变异
特征起始坐标上游100 bp内等位基因之间的序列变异
特征末端坐标下游100 bp内等位基因之间的序列变异
CUG密码 C3_04290C_A:2
C3_04290C_B:2号
其他菌株使用的系统名称 CAWG_02741号(白色念珠菌WO-1)
中的同源基因念珠菌物种 杜氏梭菌CD36正交测井：抄送36_84230
C.近矽肺CDC317正交测井：CPAR2_805850
金黄色葡萄球菌B8441正交测井：B9J08_005517
光滑梭菌CBS138正交测井：CAGL0L02123g/SNF5
查看正交簇：19个基因中的19个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种的正态分布 酿酒酵母(SNF5系列)
非CGD物种中的最佳点击 A.鸟巢(安7297) ;N.克拉萨(信噪比5) ;S.pombe公司(SPAC2F7.08c系列)
J罗兹

JBrowse用于功能C3_04290C_A

GO注释 查看全部SNF5系列GO证据和参考

分子功能		  
计算型 * RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA-结合转录因子结合(国际能源署具有酿酒酵母:SNF5系列)

生物过程		  
手动管理 * 形态建成(进口)
* 细胞对热量的反应(进口)
* 细胞对饥饿的反应(进口)
* 丝状生长(进口)
* 单细胞生物种群的丝状生长(进口)
* 单细胞生物群体对热量的反应产生丝状生长(进口)
* 饥饿条件下单细胞生物种群的丝状生长(进口)
* 单种生物膜形成中细胞粘附的正调控(进口)
* 细胞-基质粘附的正调控(进口)
* 热对单细胞生物种群丝状生长的正向调节(进口)
* 饥饿对单细胞生物种群丝状生长的正向调节(进口)
* RNA聚合酶II启动子转录的正调控对假菌丝生长的正调控(IGI公司)
* 假菌丝生长的调控(IGI公司)
* RNA聚合酶II对转录的调节(进口)
* 宿主生物内或上单种生物膜的形成(进口)
* 无生命基质上单种生物膜的形成(进口)
计算型 * RNA聚合酶II启动子转录的碳分解代谢激活(国际能源署具有酿酒酵母:SNF5系列)
* 染色质重塑(国际能源署具有酿酒酵母:SNF5系列)
* 同源重组修复双链断裂(国际能源署具有酿酒酵母:SNF5系列)
* 组蛋白乙酰化(区域协调机构)
* 葡萄糖限制对侵袭性生长的正向调节(国际能源署具有酿酒酵母:SNF5系列)
* RNA聚合酶II对转录的正向调节(国际能源署具有酿酒酵母:SNF5系列)
* RNA聚合酶II的转录延伸(区域协调机构)

蜂窝组件		  
计算型 * SWI/SNF复合体(国际能源署具有酿酒酵母:SNF5系列)
* 细胞溶质(国际能源署具有酿酒酵母:SNF5型)
* 核染色体(国际能源署使用EBI：SNF5/SMARCB1/INI1系列)
* 核(国际能源署具有酿酒酵母:SNF5系列)
突变表型 查看全部SNF5系列表型细节和参考
经典遗传学
纯合零 * 附着力：降低
* 生物膜形成：异常
* 生物膜形成：减少
* 菌丝生长异常
* 刚果红抗性下降
* 卡泊芬净耐药性下降
* 营养生长：异常
* 可行的

大规模调查
空 * 可行的

序列信息 折叠 Ca22chr3A_C_albicans_SC5314:892955至890865|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 坐标: 2016-06-22 |顺序: 2016-06-22

子功能详细信息
相对
坐标		染色体
坐标		最新更新
坐标顺序
客户尽职调查1到2091892,955到890,8652016-06-222016-06-22

检索序列
序列分析工具
地图和显示
小巷位置
巷C3_04290C_B 折叠		 Ca22chr3B_C_albicans_SC5314:892932至890842|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 坐标: 2016-06-22 |顺序: 2016-06-22

子功能详细信息
相对
坐标		染色体
坐标		最新更新
坐标顺序
客户尽职调查1到2091892,932到890,8422016-06-222016-06-22

外部链接 生物网格|CGOB公司|真菌原木|FungiDB公司|GenBank（基因银行）(1,2,三,4,5) |非周期表达|踏板|PhylomeDB公司|TrEMBL公司
主要CGDID 加利福尼亚州0000195495
其他信息SNF5系列
基因/序列资源
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南SNF5系列]
1)芬克尔JS，等。(2012)白色念珠菌粘附调节剂的肖像。公共科学图书馆-病理学8（2）：e1002525
CGD论文录入  已发布条目  参考LINKOUT  参考LINKOUT  参考LINKOUT  
2)CGD（2005）orf6和orf19预测蛋白质产物的CGD比较。
CGD论文录入  
3)坎迪达数据库
CGD论文录入  
4)伯曼J（2005）将程序集4中的ORF映射到程序集19中的ORFs。
CGD论文录入  

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