白色念珠菌 软管2/C3_00780W总结

上次策划时间：2024-04-22
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总结
轨迹历史 文学 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
HOS2型 基本信息[查看参考]
标准名称 HOS2型1
系统名称，参考菌株 C3_00780W_A(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或19.5377
别名 或19.12832，IPF16053.32，IPF21733.12，IPF8228.22，轮廓4-2974_0006三，或6.15884，或6.41394，CA22952或19.3067，CaO19.53775或19.5377、C3_00780W_B、C3_007 80W
功能类型 ORF，已验证
描述 推测蛋白质脱乙酰酶、脱乙酰微管蛋白；遗传证据表明，Set3p和Hos2p共同作为一个复合体发挥作用，参与调控白细胞转换、丝状生长和毒力(1,6,7,8)
文学
Allele名称 C3_00780W_B
等位基因变异 等位基因之间的非同义变异
特征起始坐标上游100 bp内等位基因之间的序列变异
特征末端坐标下游100 bp内等位基因之间的序列变异
CUG密码 C3_00780W_A:2
C3_00780W_B:2号
其他菌株使用的系统名称 CAWG_02414号(白色念珠菌WO-1)
中的同源基因念珠菌物种 副psilosis梭菌CDC317正交测井：CPAR2_503000美元
杜氏梭菌CD36正交测井：抄送36_80710
金黄色葡萄球菌B8441正交测井：B9J08_002850
光滑梭菌CBS138正交测井：CAGL0A03322克/HOS2
查看正交簇：19个基因中的19个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种的正态分布 A.鸟巢(hosA公司) ;S.pombe公司(SPAC3G9.07c系列) ;酿酒酵母(HOS2型)
非CGD物种中的最佳点击 N.克拉萨(hda-2型)
J罗兹

JBrowse用于功能C3_00780W_A

GO注释 查看全部HOS2型GO证据和参考

分子功能		  
手动管理 * 不是: NAD依赖性组蛋白脱乙酰酶活性(国际开发协会)
* 组蛋白脱乙酰酶活性(国际空间站)
* 微管蛋白脱乙酰酶活性(国际开发协会)
计算型 * NAD依赖性组蛋白脱乙酰酶活性(国际原子能机构具有酿酒酵母:HOS2型)
* 组蛋白脱乙酰酶活性(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC3G9.07c系列)

生物过程		  
手动管理 * 生物种间相互作用的生物过程(进口,数字集成电路具有白色念珠菌:设置3)
* 丝状生长(进口)
* 单细胞生物种群的丝状生长(进口)
* 单细胞生物种群丝状生长的负调控(进口)
* 肽基赖氨酸脱乙酰化(国际开发协会)
* 表型转换(进口)
计算型 * 基因表达的表观遗传调控(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC3G9.07c系列)
* 组蛋白去乙酰化(国际原子能机构使用EBI：组蛋白脱乙酰基酶)
* 减数分裂核分裂的负调控(国际原子能机构具有酿酒酵母:HOS2型)
* 应激激活MAPK级联的正调控(国际原子能机构具有酿酒酵母:HOS2型)
* DNA模板转录的调控(国际原子能机构具有酿酒酵母:HOS2型)

蜂窝组件		  
计算型 * Rpd3L-膨胀复合物(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC3G9.07c系列)
* Set3复合体(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC3G9.07c系列,酿酒酵母:HOS2型)
* 细胞质(国际原子能机构具有S.pombe公司:SPAC3G9.07c系列)
* 核外围(国际原子能机构具有酿酒酵母:HOS2型)
突变表型 查看全部HOS2型表型细节和参考
经典遗传学
纯合零 * 生物膜形成：异常
* 菌落外观：异常
* 丝状生长：异常
* 丝状生长：增加
* 侵袭性生长：增加
* 表型转换：减少
* 可行的

大规模调查
杂合性缺失 * 可行的

空 * 可行的

序列信息 折叠 Ca22chr3A_C_albicans_SC5314:146262至147626|J罗兹
上次更新时间 协调: 2016-06-22 |顺序: 2016-06-22

子功能详细信息
相对
协调		染色体
协调		最新更新
协调顺序
光盘1到1365146,262到147,6262016年6月22日2016-06-22

检索序列
序列分析工具
地图和显示器
小巷位置
小巷C3_00780W_B 折叠		 Ca22chr3B_C_albicans_SC5314:146264至147628|J罗兹
上次更新时间 协调: 2016-06-22 |顺序: 2016-06-22

子功能详细信息
相对
协调		染色体
协调		最新更新
协调顺序
光盘1到1365146,264到147,6282016-06-222016-06-22

外部链接 生物网格|CGOB公司|Entrez基因(1,2) |真菌原木|FungiDB公司|GenBank（基因银行）(1,2,三,4,5,6) |非周期表达|踏板|PhylomeDB公司|TrEMBL公司
主要CGDID 加利福尼亚州0000178362
其他信息HOS2型
基因/序列资源
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南HOS2型]
1)Srikantha T，等人。(2001)组蛋白去乙酰化酶基因HDA1和RPD3在白色念珠菌高频表型转换的调节中起着不同的作用。J细菌183(15):4614-25
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2)CandidaDB公司
CGD论文录入  
3)伯曼J（2005）将程序集4中的ORF映射到程序集19中的ORFs。
CGD论文录入  
4)CGD（2005）orf6和orf19预测蛋白质产物的CGD比较。
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5)Maglott D公司，等人。(2007)Entrez Gene：NCBI以基因为中心的信息。核酸研究35（数据库问题）：D26-31
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6)Hnisz D，等人。(2009)转录环与染色质相遇：一个双层网络控制白色念珠菌的白色不透性转换。摩尔微生物74(1):1-15
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7)Hnisz D，等人。（2010年）Set3/Hos2组蛋白去乙酰化酶复合物减弱cAMP/PKA信号，以调节白色念珠菌的形态发生和毒力。公共科学图书馆-病理学6（5）：e1000889
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8)Karthikeyan G，等人。(2013)白色念珠菌Hos2组蛋白脱乙酰酶的功能表征。F1000分辨率2:238
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