白色念珠菌 SPO11/C2_08820C型总结

上次策划时间：2022-11-02
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总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
SPO11号机组 基本信息[查看参考]
标准名称 SPO11号机组1
系统名称，参考菌株 C2_08820C_A号(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或19.3589
别名 或19.11071，IPF19138.12，IPF14772.12，或6.2047三，或6.808三，CA08692，CaO19.35894，IPF147722，或19.3589，C2_08820C_B，C2_088 20C
要素类型 ORF，已验证
说明 DNA内切酶；在准性周期中同源染色体之间的遗传重组所需的；有丝分裂细胞产生；类似于酿酒酵母Spo11，在减数分裂过程中起重组作用(1)
文学类
Allele名称 C2_08820C_B号
等位基因变异 等位基因之间的非同义变异
特征末端坐标下游100 bp内等位基因之间的序列变异
CUG密码 C2_08820C_A:1
C2_08820C_B:1号
其他菌株使用的系统名称 电话：05965(白色念珠菌WO-1)
中的同源基因念珠菌物种 C.近矽肺CDC317正交测井：CPAR2_806190
杜氏梭菌CD36正交测井：抄送36_22990
金黄色葡萄球菌B8441正交测井：B9J08_000499
光滑梭菌CBS138正交测井：CAGL0C02783g公司
查看正交簇：19个基因中的19个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种的正态分布 S.pombe公司(SPAC17A5.11系列) ;酿酒酵母(SPO11号机组)
J罗兹

JBrowse用于功能C2_08820C_A

GO注释 查看全部SPO11号机组GO证据和参考

分子功能		  
手动管理 * DNA内切酶活性，产生3'-磷酸单酯(ISA公司具有酿酒酵母:SPO11号机组)
计算型 * ATP绑定(国际能源署使用EBI：Spo11/DNA拓扑异构酶VI，亚基A，N末端)
* DNA结合(国际能源署使用EBI：Spo11/DNA拓扑异构酶VI，亚基A，N末端，EBI：Spo11/DNA拓扑异构酶VI亚基A超家族，EBI：Spo11/DNA拓扑异构酶VI亚基A)
* DNA末端结合(国际能源署具有酿酒酵母:SPO11号机组，S.pombe公司:SPAC17A5.11系列)
* DNA拓扑异构酶II型（双链切割，ATP水解）活性(国际能源署使用EBI：Spo11/DNA拓扑异构酶VI亚基A)
* 染色质结合(国际能源署具有酿酒酵母:孢子11)

生物过程		  
手动管理 * DNA重组(进口)
* 同源重组(进口)
计算型 * 减数分裂中期I的同源染色体取向(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC17A5.11系列)
* 减数分裂时的同源染色体配对(国际能源署具有酿酒酵母:SPO11号机组)
* 减数分裂DNA双链断裂形成(国际能源署具有酿酒酵母:SPO11号机组，S.pombe公司:SPAC17A5.11系列)
* 核的零星微自噬(区域协调机构)
* 蛋白酶体介导的泛素依赖性蛋白质分解代谢过程(区域协调机构)
* 互惠减数分裂重组(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC17A5.11系列)
* 联会复合体(国际能源署具有酿酒酵母:SPO11号机组)
* 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程(区域协调机构)

蜂窝组件		  
计算型 * 染色体(国际能源署使用EBI：Spo11/DNA拓扑异构酶VI，亚基A，N末端，EBI：Spo11/DNA拓扑异构酶VI亚基A超家族，EBI：Spo11/DNA拓扑异构酶VI亚基A)
* 浓缩核染色体(国际能源署具有酿酒酵母:SPO11号机组)
* 双绞线断裂位置(国际能源署具有S.pombe公司:SPAC17A5.11系列)
突变表型 查看全部SPO11号机组表型细节和参考
经典遗传学
纯合零 * 有丝分裂重组：缺失
* 有丝分裂重组：减少
* 可行的

大规模调查
空 * 可行的

序列信息 折叠 Ca22chr2A_C_albicans_SC5314:1792331至1791402|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 坐标: 2016-01-21 |序列: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
坐标		染色体
坐标		最新更新
坐标序列
光盘1到9301,792,331到1,791,4022016-01-212014-06-24

检索序列
序列分析工具
地图和显示
小巷位置
巷C2_08820C_B 折叠		 Ca22chr2B_C_albicans_SC5314:1792355至1791426|J罗兹
注：该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 坐标: 2016-01-21 |序列: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
坐标		染色体
坐标		最新更新
坐标序列
光盘1到9301,792,355到1,791,4262016-01-212014-06-24

外部链接 CGOB公司|Entrez基因(1，2) |真菌正交|FungiDB公司|GenBank（基因银行）(1，2，三，4，5，6) |非周期表达|踏板|系统发育数据库|TrEMBL公司|转录模块
主要CGDID 加利福尼亚州0000174721
其他信息SPO11号机组
基因/序列资源
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南SPO11号机组]
1)叉车A，等。(2008)白色念珠菌的副性周期为重组菌株的形成提供了另一种减数分裂途径。公共科学图书馆生物6（5）：e110
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  参考LINKOUT  参考LINKOUT  
2)CandidaDB公司
CGD论文录入  
3)CGD（2005）orf6和orf19预测蛋白质产物的CGD比较。
CGD论文录入  
4)Maglott D公司，等。(2007)Entrez Gene：NCBI以基因为中心的信息。核酸研究35（数据库问题）：D26-31
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