白色念珠菌 RIM101/C1_14340C型总结

上次策划时间:2024-04-22
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总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
RIM101公司 基本信息[查看参考]
标准名称 RIM101公司1
系统名称,参考菌株 C1_14340C_A号(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或9.7247英镑
别名 人力资源M1011,PRR22
或6.8147,IPF822.2,续4-3014_00324,CA5367,CaO19.72475或19.7247、C1_14340C_B、C1_143 40C
要素类型 ORF,已验证
描述 转录因子;碱性pH响应;碱诱导菌丝生长所需;在小鼠毒性中的作用;通过C-末端蛋白水解裂解激活;调节积极和消极调节;蜘蛛生物膜诱导(6,7,8,9,10,11,12)
文学类
Allele名称 C1_14340C_B
等位基因变异 特征无等位基因变异
CUG密码 C1_14340C_A:1
C1_14340C_B:1
其他菌株使用的系统名称 CAWG_00020号(白色念珠菌WO-1)
中的同源基因念珠菌物种 C.近矽肺CDC317正交测井:CPAR2_700450号
金合欢B8441正交测井:B9J08_003060
杜氏梭菌CD36正交测井:镉36_13310
光滑梭菌CBS138正交测井:CAGL0E03762克
查看正交簇:19个基因中的19个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种的正态分布 酿酒酵母(RIM101公司)
非CGD物种中的最佳点击 A.鸟巢(太平洋海岸) ;N.克拉萨(NCU00090系列) ;S.pombe公司(SPAC6G10.12c系列)
J罗兹

JBrowse用于功能C1_14340C_A

GO注释 查看全部边缘101GO证据和参考

分子功能
 
手动管理 * DNA结合(国际开发协会)
* DNA-结合转录激活物活性(进口)
高吞吐量 * DNA结合转录因子活性(国际空间站)
计算型 * DNA结合转录抑制活性,RNA聚合酶Ⅱ特异性(国际能源署具有酿酒酵母:RIM101公司)

生物过程
 
手动管理 * 生物种间相互作用的生物过程(进口)
* 细胞对碱性pH值的反应(进口)
* 细胞对生物刺激的反应(进口)
* 细胞对铜离子的反应(进口)
* 细胞对药物的反应(进口)
* 细胞对铁离子饥饿的反应(进口)
* 细胞对锂离子的反应(进口)
* 细胞对中性pH值的反应(进口)
* 细胞对pH值的反应(国际开发协会,进口,IGI公司具有白色念珠菌:SNF7型)
* 厚垣孢子形成(进口)
* 丝状生长(进口,IGI公司)
* 单细胞生物种群的丝状生长(进口)
* 化学刺激下单细胞生物种群的丝状生长(进口)
* 中性pH值对单细胞生物种群丝状生长的影响(进口)
* pH值对单细胞生物种群丝状生长的影响(进口)
* pH值对单细胞生物种群丝状生长的负调控(进口)
* T细胞耐受诱导的正调控(进口,IGI公司)
* 单细胞生物种群丝状生长的正调控(进口)
* 生物刺激对单细胞生物种群丝状生长的正向调节(进口)
* 化学刺激对单细胞生物种群丝状生长的正向调节(进口)
* RNA聚合酶II对转录的调节(国际空间站,进口)
* 信号转导(IGI公司具有白色念珠菌:序号F7)
* 共生体进入宿主(进口)
* 共生体介导的宿主炎症反应扰动(进口)
高吞吐量 * DNA模板转录的调控(国际空间站)
计算型 * 子囊孢子形成(国际能源署具有酿酒酵母:RIM101公司)
* 细胞对碱性pH值的反应(国际能源署具有酿酒酵母:RIM101公司)
* 细胞对缺氧的反应(国际能源署具有酿酒酵母:RIM101公司)
* 细胞对化学刺激的反应(区域协调机构)
* 化学刺激下单细胞生物种群的丝状生长(区域协调机构)
* 真菌型细胞壁生物发生(国际能源署具有酿酒酵母:RIM101公司)
* 减数分裂细胞周期(国际能源署具有酿酒酵母:RIM101公司)
* RNA聚合酶II对转录的负调控(国际能源署具有酿酒酵母:RIM101公司)
* 隔膜组件的正向调节(国际能源署具有酿酒酵母:RIM101公司)
* RNA聚合酶II对转录的正向调节(国际能源署具有酿酒酵母:RIM101公司)

蜂窝组件
 
手动策划 * (国际空间站)
计算型 * (国际能源署具有酿酒酵母:RIM101公司)
突变表型 查看全部RIM101公司表型细节和参考
经典遗传学
激活 * 耐尼可霉素Z:增加

杂合性缺失 * 丝状生长:减少
* 可行的
* 毒力:正常

纯合零 * 耐碱性:降低
* 丝状生长:无
* 丝状生长:减少
* 芽管形成:减少
* 芽管形成:正常
* 菌丝生长:无
* 诱导宿主反应:减少
* 与主机/环境的交互:异常
* 与主机/环境的交互:减少
* 侵袭性生长:减少
* 金属电阻:降低
* 卡泊芬净耐药性下降
* 氟康唑耐药性下降
* 铁螯合剂抗性降低
* 耐锂(1+):降低
* 米卡芬净抗性下降
* 十二烷基硫酸钠抗性降低
* 对伏立康唑的耐药性:降低
* 多肽抗生素耐药性增加
* 对石灰乳白色的抗性:正常
* 耐尼可霉素Z:正常
* 铁资源利用率下降
* 营养生长:速率下降
* 营养生长:正常速率
* 可行的
* 毒力:降低

过度表达 * 丝状生长:减少

大规模调查
杂合性缺失 * 可行的

纯合零 * 耐碱性:降低
* 生物膜形成:正常
* 厚垣孢子形成减少
* 菌落外观:异常
* 竞技体能:正常
* 菌丝生长:减少
* 离子抗应激性:降低
* 金属电阻:降低
* 对EDTA的抗性:降低
* 雷帕霉素耐药性下降
* 十二烷基硫酸钠抗性降低
* 营养生长:正常速率
* 可行的
* 毒力:降低
* 毒力:正常

* 可行的

序列信息 折叠 Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:3160450至3158465|J罗兹
注:该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 协调: 2016-01-21 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
协调
染色体
协调
最新更新
协调顺序
客户尽职调查119863,160,4503,158,4652016-01-212014-06-24

检索序列
序列分析工具
地图和显示
小巷位置
等位基因C1_14340C_B
折叠
Ca22chr1B_C_albicans_SC5314:3160503至3158518|J罗兹
注:该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 协调: 2016-01-21 |顺序:2014年6月24日

子功能详细信息
相对
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染色体
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最新更新
协调顺序
客户尽职调查119863,160,5033,158,5182016-01-212014-06-24

外部链接 生物网格|CGOB公司|Entrez基因|真菌原木|FungiDB公司|GenBank(基因银行)(1,2,)|非周期表达|踏板|PhylomeDB公司|瑞士保护银行|TrEMBL公司
主要CGDID 加利福尼亚州0000174156
其他信息RIM101公司
基因/序列资源
LOCUS总结注释RIM101公司(上次更新时间:2011-05-03)
  • 锌指转录因子与A.鸟巢pacC参与控制pH变化引起的形态变化;突变体在碱性pH条件下不能诱导碱性表达基因或抑制酸性表达基因(2)
  • 调节电路的一部分,控制酵母菌到菌丝的转变,以响应pH值的变化(9)
  • 激活RIM101公司碱性-中性条件下的途径发生在内体:非活性全长边缘101p通过其C末端抑制结构域与支架蛋白的结合被募集到内涵体膜边缘20p; 这种互动带来边缘101p接近边缘13p,一种钙蛋白酶样蛋白酶,通过Snf7p公司;边缘13p切断边缘101p活性形式转移到细胞核,在那里它控制中性碱性pH依赖的转录反应(13,14,15)
  • 成丝基因的pH依赖性表达受RIM101依赖性途径和MDS3系统-依赖性途径(16)
  • (17)
  • 系统性念珠菌病小鼠模型中突变体的毒性降低(9)
  • 口咽念珠菌病模型中突变体表现出毒力缺陷(18)
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南RIM101公司]
1)威尔逊·RB,等。(1999)通过短同源区域的基因破坏对白色念珠菌进行快速假设测试。J细菌181(6):1868-74
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  
2)拉蒙AM,等。(1999)环境pH对白色念珠菌形态发育的影响是通过PRR2编码的PacC相关转录因子介导的。J细菌181(24):7524-30
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3)CandidaDB公司
CGD论文录入  
4)伯曼J(2005)将程序集4中的ORF映射到程序集19中的ORFs。
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5)马格洛特D,等。(2007)Entrez Gene:NCBI以基因为中心的信息。核酸研究35(数据库问题):D26-31
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7)戴维斯·D,等。(2000)白念珠菌的pH反应受RIM101依赖性和诱导性途径控制。分子细胞生物学20(3):971-8
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8)Ramon AM和Fonzi WA(2003)PacC的白色念珠菌同源株Rim101p的不同结合特异性。真核细胞2(4):718-28
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9)Davis D,等。(2000)白念珠菌RIM101 pH反应通路是宿主-猪源相互作用所必需的。感染免疫68(10):5953-9
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10)Davis D(2003)白色念珠菌对环境pH值的适应及其与发病的关系。当前基因44(1):1-7
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11)本森ES,等。(2004)白色念珠菌的转录谱揭示了Rim101p对细胞外pH值和功能的新适应性反应。摩尔微生物54(5):1335-51
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12)贵族CJ,等。(2012)最近进化的转录网络控制白色念珠菌生物膜的发育。单元格148(1-2):126-38
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13)Xu W和Mitchell AP(2001)酵母PalA/AIP1/Alix同源物Rim20p与PEST样区域结合,是其蛋白水解切割所必需的。J细菌183(23):6917-23
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14)徐伟,等。(2004)多泡体-ESCRT组分在酿酒酵母和白色念珠菌的pH反应调节中起作用。分子生物学细胞15(12):5528-37
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15)李明,等。(2004)白色念珠菌Rim13p,在酸性和碱性pH下处理Rim101p所需的蛋白酶。真核细胞3(3):741-51
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16)Davis DA,等。(2002)白色念珠菌Mds3p,通过插入突变鉴定的pH反应和毒力的保守调节器。遗传学162(4):1573-81
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  
17)白玉,等。(2006)白色念珠菌Rim101是细胞壁β糖苷酶Phr2的直接转录阻遏物,新的pH依赖性调节的证据。真核细胞5(9):1550-9
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18)贵族CJ,等。(2008)白色念珠菌转录因子Rim101通过细胞壁功能介导致病性相互作用。细胞微生物学10(11):2180-96
CGD论文录入  Pubmed条目  参考LINKOUT  数据  


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