RIM101公司 基本信息[查看参考] |
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系统名称,参考菌株 | | C1_14340C_A号(白色念珠菌SC5314) |
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别名 | | 人力资源M1011,PRR22 或6.8147三,IPF822.2三,续4-3014_00324,CA5367三,CaO19.72475或19.7247、C1_14340C_B、C1_143 40C |
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描述 | | 转录因子;碱性pH响应;碱诱导菌丝生长所需;在小鼠毒性中的作用;通过C-末端蛋白水解裂解激活;调节积极和消极调节;蜘蛛生物膜诱导(6,7,8,9,10,11,12) |
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CUG密码 | | C1_14340C_A:1 C1_14340C_B:1 |
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其他菌株使用的系统名称 | | CAWG_00020号(白色念珠菌WO-1) |
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J罗兹 | |
JBrowse用于功能C1_14340C_A
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序列信息 | | Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:3160450至3158465|J罗兹 注:该特征编码在Crick链上。 | 上次更新时间 | | 协调: 2016-01-21 |顺序: 2014-06-24 | 子功能详细信息 | | | | 相对 协调 | | 染色体 协调 | | 最新更新 |
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协调 | | 顺序 | 客户尽职调查 | | 1 | 到 | 1986 | | 3,160,450 | 到 | 3,158,465 | | 2016-01-21 | | 2014-06-24 |
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序列信息 | | Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:3160450至3158465|J罗兹 注:该特征编码在Crick链上。 |
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小巷位置 等位基因C1_14340C_B | | Ca22chr1B_C_albicans_SC5314:3160503至3158518|J罗兹 注:该特征编码在Crick链上。 | 上次更新时间 | | 协调: 2016-01-21 |顺序:2014年6月24日 | 子功能详细信息 | | | | 相对 协调 | | 染色体 协调 | | 最新更新 |
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协调 | | 顺序 | 客户尽职调查 | | 1 | 到 | 1986 | | 3,160,503 | 到 | 3,158,518 | | 2016-01-21 | | 2014-06-24 |
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小巷位置 艾伦C1_14340C_B | | Ca22chr1B_C_albicans_SC5314:3160503至3158518|J罗兹 注:该特征编码在Crick链上。 |
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LOCUS总结注释RIM101公司(上次更新时间:2011-05-03) |
- 锌指转录因子与A.鸟巢pacC参与控制pH变化引起的形态变化;突变体在碱性pH条件下不能诱导碱性表达基因或抑制酸性表达基因(2)
- 调节电路的一部分,控制酵母菌到菌丝的转变,以响应pH值的变化(9)
- 激活RIM101公司碱性-中性条件下的途径发生在内体:非活性全长边缘101p通过其C末端抑制结构域与支架蛋白的结合被募集到内涵体膜边缘20p; 这种互动带来边缘101p接近边缘13p,一种钙蛋白酶样蛋白酶,通过Snf7p公司;边缘13p切断边缘101p活性形式转移到细胞核,在那里它控制中性碱性pH依赖的转录反应(13,14,15)
- 成丝基因的pH依赖性表达受RIM101依赖性途径和MDS3系统-依赖性途径(16)
- (17)
- 系统性念珠菌病小鼠模型中突变体的毒性降低(9)
- 口咽念珠菌病模型中突变体表现出毒力缺陷(18)
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1) | 威尔逊·RB,等。(1999)通过短同源区域的基因破坏对白色念珠菌进行快速假设测试。J细菌181(6):1868-74 | 2) | 拉蒙AM,等。(1999)环境pH对白色念珠菌形态发育的影响是通过PRR2编码的PacC相关转录因子介导的。J细菌181(24):7524-30 | 3) | CandidaDB公司 | 4) | 伯曼J(2005)将程序集4中的ORF映射到程序集19中的ORFs。 | 5) | 马格洛特D,等。(2007)Entrez Gene:NCBI以基因为中心的信息。核酸研究35(数据库问题):D26-31 | 6) | El Barkani A,等。(2000)RIM101(PRR2)的显性活性等位基因绕过了白色念珠菌丝状化的pH限制。分子细胞生物学20(13):4635-47 | 7) | 戴维斯·D,等。(2000)白念珠菌的pH反应受RIM101依赖性和诱导性途径控制。分子细胞生物学20(3):971-8 | 8) | Ramon AM和Fonzi WA(2003)PacC的白色念珠菌同源株Rim101p的不同结合特异性。真核细胞2(4):718-28 | 9) | Davis D,等。(2000)白念珠菌RIM101 pH反应通路是宿主-猪源相互作用所必需的。感染免疫68(10):5953-9 | 10) | Davis D(2003)白色念珠菌对环境pH值的适应及其与发病的关系。当前基因44(1):1-7 | 11) | 本森ES,等。(2004)白色念珠菌的转录谱揭示了Rim101p对细胞外pH值和功能的新适应性反应。摩尔微生物54(5):1335-51 | 12) | 贵族CJ,等。(2012)最近进化的转录网络控制白色念珠菌生物膜的发育。单元格148(1-2):126-38 | 13) | Xu W和Mitchell AP(2001)酵母PalA/AIP1/Alix同源物Rim20p与PEST样区域结合,是其蛋白水解切割所必需的。J细菌183(23):6917-23 | 14) | 徐伟,等。(2004)多泡体-ESCRT组分在酿酒酵母和白色念珠菌的pH反应调节中起作用。分子生物学细胞15(12):5528-37 | 15) | 李明,等。(2004)白色念珠菌Rim13p,在酸性和碱性pH下处理Rim101p所需的蛋白酶。真核细胞3(3):741-51 | 16) | Davis DA,等。(2002)白色念珠菌Mds3p,通过插入突变鉴定的pH反应和毒力的保守调节器。遗传学162(4):1573-81 | 17) | 白玉,等。(2006)白色念珠菌Rim101是细胞壁β糖苷酶Phr2的直接转录阻遏物,新的pH依赖性调节的证据。真核细胞5(9):1550-9 | 18) | 贵族CJ,等。(2008)白色念珠菌转录因子Rim101通过细胞壁功能介导致病性相互作用。细胞微生物学10(11):2180-96 |
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