白色念珠菌 IRA2/C1_12450C总结

上次策划时间:2022-09-20
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总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
爱尔兰共和国2 基本信息[查看参考]
标准名称 IRA2型1
系统名称,参考菌株 C1_12450C_A号(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或19.5219
别名 或F19.12686,IPF21959.12,IPF10866.22,或6.3680,1967年2,CaO19.52194,IPF108662或19.5219、C1_12450C_B、C1_124050C
要素类型 ORF,已验证
描述 GTP酶激活蛋白;通过将RAS从GTP-转化为GDP-结合的非活性形式,对其进行负调控;蜘蛛生物膜诱导;抑制生物膜的流动模型(5)
文学类
名称说明 酿酒酵母IRA2的直系同源性
Allele名称 C1_12450C_B号
等位基因变异 等位基因之间的非同义变异
CUG密码 C1_12450C_A:11号
C1_12450C_B:11号
其他菌株使用的系统名称 CAWG_00196号(白色念珠菌WO-1)
中的同源基因念珠菌物种 C.近矽肺CDC317正交测井:CPAR2_700680
杜氏梭菌CD36正交测井:镉36_11650
金黄色葡萄球菌B8441正交测井:B9J08_003924/IRA2
光滑梭菌CBS138正交测井:CAGL0I07909克
查看正交簇:18个基因中的18个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种的正态分布 N.克拉萨(NCU01642型) ;酿酒酵母(爱尔兰共和国2)
非CGD物种中的最佳点击 A.鸟巢(AN3735型) ;S.pombe公司(SPBC646.12c型)
J罗兹

JBrowse用于功能C1_12450C_A

GO注释 查看全部爱尔兰共和国2GO证据和参考

分子功能
 
计算型 * GTP酶激活剂活性(国际能源署具有C.奥里斯:爱尔兰共和国2,酿酒酵母:爱尔兰共和国2)

生物过程
 
手动管理 * 无生命基质上单种生物膜形成的正调控(进口)
计算型 * 蛋白信号转导(国际能源署具有C.奥里斯:爱尔兰共和国2)
* 腺苷酸环化酶抑制G蛋白偶联受体信号通路(国际能源署具有酿酒酵母:爱尔兰共和国2)
* 细胞粘附(区域协调机构)
* Ras蛋白信号转导的负调控(国际能源署具有酿酒酵母:IRA2型)
* GTPase活性的调节(国际能源署使用EBI:Ras GTPase激活蛋白,保守位点,EBI:Ras GTPase激活域)
* 糖原代谢过程的调控(国际能源署具有C.奥里斯:爱尔兰共和国2)
* 运输(区域协调机构)

蜂窝组件
 
计算 * 内质网膜(国际能源署具有酿酒酵母:爱尔兰共和国2)
* 线粒体(国际能源署具有酿酒酵母:爱尔兰共和国2)
突变表型 查看全部爱尔兰共和国2表型细节和参考
经典遗传学
纯合零 * 生物膜形成:减少

* 生物膜形成:减少

大规模调查
杂合性缺失 * 单元格大小:增加
* 可行的

* 可行的

可压制的 * 营养生长:减少
* 可行的

序列信息 折叠 Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:2716906至2708975|J罗兹
注:该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 坐标: 2016-01-21 |序列:2014年6月24日

子功能详细信息
相对
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染色体
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最新更新
坐标序列
客户尽职调查179322,716,9062708975个2016-01-212014-06-24

检索序列
序列分析工具
地图和显示
小巷位置
艾伦C1_12450C_B
折叠
Ca22chr1B_C_albicans_SC5314:2716947至2709016|J罗兹
注:该特征编码在Crick链上。
上次更新时间 坐标: 2016-01-21 |序列: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
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染色体
坐标
最新更新
坐标序列
客户尽职调查179322716947个2,709,0162016-01-212014-06-24

外部链接 CGOB公司|Entrez基因(1,2) |真菌原木|FungiDB公司|GenBank(基因银行)(1,2,,4,5,6) |非周期表达|踏板|PhylomeDB公司|TrEMBL公司
主要CGDID 加利福尼亚州0000177461
其他信息爱尔兰共和国2
基因/序列资源
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南爱尔兰共和国2]
1)乌普鲁里P,等。(2007)白色念珠菌固定相浮游酵母细胞不同大小RNA种类的分析。FEMS酵母研究7(1):110-7
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2)坎迪达数据库
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3)CGD(2005)orf6和orf19预测蛋白质产物的CGD比较。
CGD论文录入  
4)马格洛特D,等。(2007)Entrez Gene:NCBI以基因为中心的信息。核酸研究35(数据库问题):D26-31
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5)贵族CJ,等。(2012)最近进化的转录网络控制白色念珠菌生物膜的发育。单元格148(1-2):126-38
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