白色念珠菌 ZCF28/C1_09100W型总结

上次策划时间:2021-02-08
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总结
轨迹历史 文学类 基因本体论 表型 同系物 蛋白质
       
ZCF28型 基本信息[查看参考]
标准名称 ZCF28型1,2
系统名称,参考菌株 C1_09100W_A型(白色念珠菌SC5314)
组件19/21标识符 或19.4767
别名 或19.12231,IPF22464.1,IPF14255.2,轮廓4-2264_00054,或6.25415,CA1174,CaO19.122316,CaO19.47676,IPF14255或19.4767、C1_09100W_B、C1_09200W
要素类型 ORF,已验证
描述 锌(II)2Cys6转录因子;要求酵母细胞粘附在硅酮基质上;蜘蛛生物膜诱导(1,2,7,8,9)
文学类
Allele名称 C1_09100W_B型
等位基因变异 等位基因之间的非同义变异
C1_09100W_A缺少终止密码子
特征起始坐标上游100 bp内等位基因之间的序列变异
CUG密码 C1_09100W_A:1号
C1_09100W_B:1号
其他菌株使用的系统名称 CAWG_00519(白色念珠菌WO-1)
中的同源基因念珠菌物种 查看正交簇:2个基因中有2个念珠菌-相关物种/菌株
非CGD物种中的最佳点击 A.鸟巢(AN10262型) ;N.克拉萨(新冠肺炎03728) ;S.pombe公司(编号965.10)
J罗兹

JBrowse用于功能C1_09100W_A

GO注释 查看全部ZCF28型GO证据和参考

分子功能
 
高吞吐量 * DNA结合转录因子活性(国际空间站)
计算型 * DNA结合转录因子活性,RNA聚合酶Ⅱ特异性(国际能源署使用EBI:Zn(2)Cys(6)真菌型DNA结合域,电子邮箱:Zn(2)-C6真菌型DNA结合域超家族)
* 锌离子结合(国际能源署使用EBI:Zn(2)Cys(6)真菌型DNA结合域,EBI:Zn(2)-C6真菌型DNA结合域超家族)

生物过程
 
手动策划 * 单种生物膜形成中细胞粘附的正调控(进口)
* 细胞-基质粘附的正调控(进口)
* RNA聚合酶II对转录的调节(进口)
* 无生命基质上单种生物膜的形成(进口)
高吞吐量 * DNA模板转录的调控(国际空间站)
计算型 * 线粒体自噬(区域协调机构)
* 核的零星微自噬(区域协调机构)

蜂窝组件
 
手动策划 * 细胞成分未知(ND(无损检测))
突变表型 查看全部ZCF28型表型细节和参考
经典遗传学
纯合零 * 附着力:降低
* 静止期存活率下降
* 可行的

大规模调查
纯合零 * 生物膜形成:正常
* 可行的

* 可行的

可压制的 * 营养生长:正常速率
* 可行的

序列信息 折叠 Ca22chr1A_C_albicans_SC5314:1985645至1986385|J罗兹
上次更新时间 协调: 2016-01-21 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
协调
染色体
协调
最新更新
协调顺序
客户尽职调查17411,985,6451,986,3852016-01-212014-06-24

检索序列
序列分析工具
地图和显示
小巷位置
艾伦C1_09100W_B
折叠
Ca22chr1B_C_albicans_SC5314:1985677至1986417|J罗兹
上次更新时间 协调: 2016-01-21 |顺序: 2014-06-24

子功能详细信息
相对
协调
染色体
协调
最新更新
协调顺序
客户尽职调查17411,985,6771,986,4172016-01-212014-06-24

外部链接 CGOB公司|Entrez基因(1,2)|真菌原木|FungiDB公司|GenBank(基因银行)(1,2,,4,5,6)|非周期表达|踏板|PhylomeDB公司|TrEMBL公司
主要CGDID 加利福尼亚州0000189226
其他信息ZCF28型
基因/序列资源
本页引用的参考文献[查看的完整文献指南ZCF28型]
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