光滑梭菌 KGD1/CAGL0G08712克基因本体注释

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此页面在不同部分显示GO注释根据注释参考中使用的方法:
       
  • 手动控制GO注释:包括基于针对特定基因的已发表实验或分析的注释。
  • 高通量实验的GO注释:包括在高通量或全基因组基础上进行的已发表实验的注释。
  • 计算GO注释:包括通过计算方法预测的注释(例如,序列相似性比较),并且没有单独审查。

科威特第纳尔1 手动控制GO注释*:跳转到:顶部 | 计算型 | 高吞吐量
上次审核日期:2024-01-10   

KGD1没有手动控制的GO注释。

*手动固化GO注释反映了我们对基本分子功能,生物过程、和蜂窝组件对于这个基因产品。CGD策展人根据已发表的小规模实验指定手动编辑注释。策展人定期审查所有手动编辑的GO注释的准确性和完整性。本节顶部的“上次审阅时间:”日期表示上次审阅这些批注的时间。

千克1 高通量实验中的GO注释**:跳转到:顶部 | 计算型 | 手动管理

KGD1的高通量实验中没有GO注释。

**GO注释来自高通量实验基于各种大规模高通量实验,包括全基因组实验。这些注释中的许多是基于作者指定的GO注释(或到GO注释的映射)而不是CGD管理员指定的。虽然CGD策展人阅读这些出版物,并经常与作者密切合作以纳入信息,但每个单独的注释不一定由策展人审查。只有当这种类型的数据可用时,才会分配高通量实验的GO注释,因此可能不会分配到基因本体论的所有三个方面。

科威特第纳尔1 计算GO注释***:跳转到:顶部 | 高吞吐量 | 手动管理
分子功能|生物过程|蜂窝组件

分子功能的计算预测
注释参考文献证据分配人
氧化还原酶活性,作用于供体的醛基或氧基,二硫作为受体CGD(2011)基于蛋白质特征(如结构域和基序)的基因本体(GO)注释预测
CGD论文录入  
国际能源署:从电子注释推断使用EBI:脱氢酶,E1组分
2024-01-09分配
CGD公司
氧戊二酸脱氢酶(琥珀酰转移)活性CGD(2011)基于蛋白质特征(如结构域和基序)的基因本体(GO)注释预测
CGD论文录入  
国际能源署:从电子注释推断使用EBI:2-酮戊二酸脱氢酶E1组分
2024-01-09分配
CGD公司
焦磷酸硫胺素结合CGD(2011)基于蛋白质特征(如结构域和基序)的基因本体(GO)注释预测
CGD论文录入  
国际能源署:从电子注释推断使用EBI:2-酮戊二酸脱氢酶E1组分
2024-01-09分配
CGD公司

生物过程的计算预测
注释参考文献证据分配人
三羧酸循环CGD(2011)基于蛋白质特征(如结构域和基序)的基因本体(GO)注释预测
CGD论文录入  
即:从电子注释推断使用EBI:2-酮戊二酸脱氢酶E1组分
2024-01-09分配
CGD公司

细胞成分的计算预测
注释参考文献证据分配者
线粒体核仁CGD(2008)基于正形学的基因本体(GO)注释预测
CGD论文录入  
国际能源署:从电子注释推断具有酿酒酵母:科威特第纳尔1
2024-01-10分配
CGD公司
线粒体酮戊二酸脱氢酶复合物CGD(2008)基于正形学的基因本体(GO)注释预测
CGD论文录入  
国际能源署:从电子注释推断具有酿酒酵母:科威特第纳尔1
2024-01-10分配
CGD公司

***计算型GO注释是基于计算方法(例如序列相似性比较)的预测,不由馆长单独审查。


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