表达式规范化工作流

基因表达规范化工作流


生物导体版本:释放(3.19)

一个广泛的、定制的表达规范化工作流程,其中包含了Microarryas监督规范化(SNM)、替代变量分析(SVA)和主方差成分分析,以识别批处理效应并将其从表达数据中删除,从而增强检测潜在生物信号的能力。

作者:Karthikeyan Murugesan[aut,cre],Greg Gibson[sad,ths]

维护人员:Karthikeyan Murugesan<雅虎网站上的karthikeyanm60>

引文(从R中输入引文(“ExpressionNormalizationWorkflow”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“ExpressionNormalizationWorkflow”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“ExpressionNormalizationWorkflow”)
基因表达规范化工作流 HTML格式 R脚本

细节

生物视图 GeneExpressionWorkflow(通用表达式工作流),免疫肿瘤学工作流程,工作流
版本 1.30.0
许可证 GPL(>=3)
取决于
进口 博科生物(>= 2.24.0),利马(>= 3.20.9),lme4公司(>= 1.1.7),矩阵统计(>= 0.10.3),pvca公司(>= 1.4.0),信噪比(>= 1.12.0),特别行政区(>= 3.10.0),vsn(vsn)(>= 3.32.0)
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 表达式规范化工作流_1.30.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExpressionNormalization工作流
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ExpressionNormalizationWorkflow
包短Url https://bioductor.org/packages/ExpressionNormalizationWorkflow(https://bioductor.org/packages/ExpressionNormalizationWorkflow)/
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