甲状旁腺SE

Haglund等人的甲状旁腺肿瘤原代培养RNA-Seq的范围总结实验，《临床内分泌代谢杂志》2012年。

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包为甲状旁腺肿瘤原代培养实验中的配对RNA-Seq数据提供了基因和外显子读取计数的RangedSummarized实验对象。Haglund F、Ma R、Huss M、Sulaiman L、Lu M、Nilsson IL、Hoog a、Juhlin CC、Hartman J、Larsson C、J Clin Endocrinol Metab在《甲状旁腺腺瘤中功能性雌激素受体的证据》一文中介绍了这些数据。jc.2012-2484，Epub 2012年9月28日，PMID:23024189。在3种条件（DPN、OHT和对照）下的2个时间点对4名患者的肿瘤培养物进行测序。由于质量低，论文作者省略了一个对照样品。包装小插曲描述了根据NCBI基因表达综合公司提供的原始测序数据创建对象，登录号为GSE37211。基因和外显子特征为GRCh37 Ensemble注释。

作者：迈克尔·洛夫

维护人员：迈克尔·洛夫（Michael Love）<michaelisaiahlove at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“甲状旁腺素”）):

安装

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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“甲状旁腺酶”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

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浏览幻影（“甲状旁腺”）

甲状旁腺基因SE	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式

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细节

生物视图	实验数据,RNASeq数据,排序数据
版本	1.42.0
许可证	LGPL公司
取决于	R（>=3.5.0），总结性实验
进口
系统要求
统一资源定位地址

建议	Rsamtools软件,基因组比对,地理查询,SRAdb公司,基因组特征,仿生风格
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建议我	类别R,DEXSeq公司
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程序包档案

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源程序包	甲状旁腺SE_1.42.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/甲状旁腺SE
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/甲状旁腺SE
包短Url	https://bioconductor.org/packages/parathyria SE（https://bioconductor.org/packages/parathyria SE）/
软件包下载报告	下载统计信息