AHPubMedDbs公司

AnnotationHub的SQLite、tibbles和data.tables


生物导体版本:释放(3.19)

为AnnotationHub提供PubMed的一些预处理sqlite、tible和data.table数据集。所有数据集都是由我们的Snakemake工作流[PubMed-workflow]生成的(https://github.com/rikenbit/pubmed-workflow). 有关详细信息,请参阅pubmed-workflow的README.md。

作者:Koki Tsuyuzaki[aut,cre],Manabu Ishii[aut],Itoshi Nikaido[aut'

维护人员:Koki Tsuyuzaki<k.t.the-answer at hotmail.co.jp>

引文(从R中输入引文(“AHPubMedDbs”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“AHPubMedDbs”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“AHPubMedDbs”)
为AnnotationHub提供PubMed数据集 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 注释数据,批注中心
版本 1.8.0
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.1.0)
进口 批注中心(>= 2.22.0)
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/rikenbit/AHPubMedDbs/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 AHPubMedDbs_1.8.0.tar.gz公司
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
包短Url https://bioconductor.org/packages/AHPubMedDbs/
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