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稳健概率平均(RPA)
稳健概率平均(RPA)是一种完全可扩展的probelevel预处理和分析算法任何大小的短寡核苷酸微阵列集合任意大微阵列的中等大小标准数据集包含数万个或更多样本的地图集。
Affymetrix基因表达阵列可使用特殊包装和系统发育微阵列(HITChip)。
RPA还提供了明确的数据驱动的特定于探针的估计基于严格概率模型和在基准测试中显著优于标准RMA模型(2013年NAR),在同时实现了完全的可扩展性。
引用RPA
RPA方法已记录在这两个文件中出版物。请酌情引用:
一种可扩展的短寡核苷酸微阵列图谱在线预处理算法Leo Lahti、Aurora Torrente、Laura L Elo、Alvis Brazma、Johan Rung。核酸研究41(10):e110,2013年。
短寡核苷酸阵列差异基因表达研究中探针可靠性的概率分析利奥·拉赫蒂(Leo Lahti)、劳拉·埃洛(Laura L.Elo)、特罗·艾托卡利奥(Tero Aittokalio)和塞缪尔·卡斯基(Samuel Kaski)。IEEE/ACM计算生物学和生物信息学汇刊8(1):217-25, 2011.