版本1.41.0的变更-------------------------修改o 1.41.5建议添加RUnito 1.41.3为即将发布的版本更新viableID.rdao 1.41.2使用dbExecute（）而不是dbGetQuery（）或dbSendQuery（增强o 1.41.4 Knoknok优化，并允许指定所需的集成版本o 1.41.1 James MacDonald修复makeOrgPackageFromNCBI以使用现有下载文件版本1.39.0的变更-------------------------修改o 1.39.1更新uniprot的REST查询o 1.39.2为即将发布的版本更新viableID.rda版本1.34.0的变更-------------------------新功能o从OrgDb和ChipDb包中删除UniGeneo在OrgDb和ChipDb包中添加基因类型表o增加了构建Orthology.eg.db包的功能，该包可以在物种之间映射NCBI基因IDo RSQLite不赞成将dbGetQuery用于数据库更改语句；更新为使用dbExecute版本1.28.0的变更------------------------新功能o（版本1.27.1）`makeOrgPackage（）`支持GO本体。版本1.18.0的变更------------------------修改o RSQLite已弃用dbGetPreparedQuery/dbSendPreparedQuery；更新为dbGetQuery/dbSendQuery/dbBind/dbFetcho BioC 3.5建筑更新BUG修复o解决tmp问题，将outputDir更改为NCBIFilesDiro修复了makeOrgPackageFromNCBI中没有GO术语时的错误版本1.16.0的变更------------------------新功能o添加检查所需的db0包是否已安装在makeDBPackage（）中o添加脚本以创建viableID数据文件修改o删除过时的单元测试并弃用ChipDb中的MAPCOUNTS程序包模板o更新ChipDb包模板以在单元测试中加载DBIo允许不带--keep-empty-dirs标志的构建o其他代码清理-描述中没有重复的依赖项-解析名称空间中的符号-可重用的单元测试（新的而不是重用临时文件）-避免不必要的粘贴（），例如消息（粘贴（））-使用loadNamespace（）而不是require（）-避免1:n迭代-格式化，例如SQL和if（）{}else{}o删除未使用的测试/runalltests。Route.save文件AnnDbPkg-模板o使用https:而不是http:进行NCBI访问o根据高级功能重命名R代码和手册页文件o bump OrgDb版本用于3.4版本o添加显式注释Dbi:：：NCBIORG_DB_SeedGenerator（）BUG修复o getFastaSpeciesDirs（）在Windows上修剪“\r”版本1.14.0的变更------------------------新功能o在OrgDbs sqlite数据库中为青蛙、黑猩猩、恒河猴和蚊子修改o更新AnnDbPkg模板man以引用select（）接口o致力于makeOrgPackageFromNCBI：-在gene_info.gz中找不到税务标识时早期出现错误-添加“rebuildCache”参数以控制重复下载-删除旧代码和注释-更新手册页o将PFAM和PROSITE手册页添加到NCBICHIP和NCBIORG包模板o允许在wrapBaseDBPackages（）中传递目录位置o更改许可证格式；报告AnnotationDbi的当前版本o修改appendArabidopsisGenes（）以检查空的“gene_id”o将DBI添加到“建议”中；在_dbconn手册页中加载DBIo在小插曲中加载SQLite；不再自由注释Dbi:：dbFileConnect（）版本1.8.0的变更------------------------新功能o添加对为所有NCBI创建orgDb对象/数据库的支持有足够数据的taxID（用于添加到AnnotationHub）。这就为1100个生物体制造了物体。版本1.6.0的变更------------------------新功能o添加对广义makeChipPackage（）函数的支持，以便使用映射到ID的探针的用户可以制作芯片包只提供他们有权访问org包（no.db0需要软件包）。o添加对创建新inparanoid8数据库的支持（用于加载到AnnotationHub中）1.4.0版的变更------------------------新功能o增加了创建生物包的更通用机制。makeOrgPackage（）现在允许用户传递一系列data.frames和（前提是格式正确）将将它们编译成一个以基因为中心的生物包。目的是为了为工作人员提供更通用的机制偏离常规路径的生物体。o更新文档（新的小插曲）以更好地阐明需要制作新生物包的用户应该怎么做。1.0.0版本中的更改------------------------o所有过去存在于AnnotationDbi中的代码主要涉及新注释包的创建现在住在这里。新功能o新的biocoViews标签已添加到生成所有新的Annotation包。这些允许用户搜索注释包的类型是。例如，您现在可以快速列出使用网站的TranscriptDb包。