traseR(轨道交通)

基因组区间内GWAS拖尾相关SNP富集分析


生物导体版本:释放(3.19)

traseR使用不同的假设检验方法在基因组区间执行GWAS trat-associated SNP富集分析,还提供各种功能来探索和可视化结果。

作者:李晨、赵慧S.秦

维护人员:李晨<李晨在emory.edu>

引文(从R中输入引文(“traseR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“traseR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“traseR”)
在基因组区间执行GWAS trait相关SNP富集分析 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 对齐,新闻报道,数据导入,遗传学,质量控制,排序,软件
版本 1.34.0
在生物导体中 生物技术3.2(R-3.2)(9年)
许可证 GPL公司
取决于 R(>=3.5.0),基因组范围,I范围,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 火车R_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 traseR_1.34.0.zip文件(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 火车R_1.34.0.tgz
macOS二进制(arm64) 火车R_1.34.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/traseR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/traseR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/traseR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/traseR/
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