轨道表

构建IGV曲目和HTML报告


生物导体版本:释放(3.19)

在HTML页面中创建复杂IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的方法。

作者:Tom Carroll、Sanjay Khadayate、Anne Pajon、Ziwei Liang

维护人员:汤姆·卡罗尔<tc.infomatics at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“跟踪表”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“跟踪表”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“轨迹表”)
使用跟踪表创建IGV HTML报告 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 报告写作,排序,软件
版本 1.38.0
在生物导体中 生物技术3.0(R-3.1)(10年)
许可证 GPL(>=3)
取决于 R(>=3.5.0)
进口 I范围,基因组范围,十六矢量,Rsamtools软件,XML格式,拖拉机底座,字符串,R彩色啤酒,方法
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 轨道表_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 轨迹表_1.38.0.zip
macOS二进制(x86_64) 轨迹表_1.38.0.tgz
macOS二进制(arm64) 轨迹表_1.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tracktables网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/轨迹表
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/tracktables网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/tracktables网站/
软件包下载报告 下载统计信息