tidy总结实验
将总结实验引入潮汐宇宙
生物导体版本:释放(3.19)
tidySummarizedExperiment包提供了一组工具,用于创建和操作SummarigedExperience对象的整洁数据表示。摘要实验是生物信息学中广泛使用的一种数据结构,用于存储高通量基因组数据,如基因表达或DNA测序数据。tidySummarizedExperiment包引入了一个整洁的框架,用于处理SummariedExperience对象。它允许用户将数据转换为整洁的格式,其中每个观察值是一行,每个变量是一列。这种整洁的表示简化了数据操作,与其他tidyverse包集成,并能够与更广泛的整洁工具生态系统无缝集成,用于数据分析。
作者:斯特凡诺·曼吉奥拉[aut,cre]
维护人员:Stefano Mangiola<mangiolastefano at gmail.com>
引文(从R中输入引文(“tidySummarizedExperiment”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“tidySummarizedExperiment”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“tidySummarizedExperiment”)
细节
生物视图 |
分析域,群集,差异表达式,基因表达式,基础设施,规范化,质量控制,RNA序列,排序,软件,转录,转录组学 |
版本 |
1.14.0 |
在生物导体中 |
生物C 3.12(R-4.0)(4年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.3.0),总结性实验,tt服务(>= 0.4.0) |
进口 |
dplyr公司,易怒的(>= 3.0.4),马格里特,三年,ggplot2,爱尔兰航空公司,呜呜声,生命周期、方法、实用程序,S4载体,潮汐选择,省略,压控变压器,支柱,字符串,克莱,范西,统计,pkg配置 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/stemangiola/tidy总结实验 |
错误报告 |
https://github.com/stemangiola/tidySummarizedExperiment/issues网站 |
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程序包档案
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