稀疏矩阵统计

稀疏矩阵行和列的汇总统计


生物导体版本:释放(3.19)

针对稀疏矩阵的行和列操作的高性能函数。例如:col/lowMeans2、col/lowMedians、col/rowVars等。目前,优化仅限于列稀疏格式的数据。该软件包的灵感来自Henrik Bengtsson的matrixStats软件包。

作者:Constantin Ahlmann-Eltze[aut,cre](君士坦丁·阿赫曼-埃尔茨)

维护人员:Constantin Ahlmann-Eltze<artjom31415,网址:googlemail.com>

引文(从R中输入引文(“spareMatrixStats”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“spareMatrixStats”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignets(“稀疏矩阵统计”)
稀疏矩阵统计 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据表示,基础设施,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 生物柴油3.11(R-4.0)(4.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 矩阵泛型(>= 1.5.3)
进口 卢比,矩阵,矩阵统计(>=0.60.0),方法
系统要求 C++11
统一资源定位地址 https://github.com/const-ae/sparseMatrixStats网站
错误报告 https://github.com/const-ae/sparseMatrixStats/issues网站
查看更多
建议 测试那个(>= 2.1.0),针织物,长凳,rmarkdown公司,仿生风格
链接到 卢比
增强功能
取决于我
导入我 阿泰纳,ccImpute(计算),延迟矩阵统计,梦想家,GSVA公司,辛布,智能ID,平滑簇,聚光灯,形容词,CR指标,GrabSVG公司,妈妈,scBSP公司
建议我 矩阵泛型,scPCA公司,锌波,单细胞干草垛
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 稀疏矩阵统计_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 稀疏矩阵统计_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64) 稀疏矩阵统计_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64) 稀疏矩阵统计_1.16.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spareMatrixStats网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/spareMatrixStats
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/sparseMatrixStats网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/spareMatrixStats网站/
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