弹弓

用于排序单细胞测序的工具

生物导体版本：释放（3.19）

提供用于推断低维数据中连续分支谱系结构的函数。Slingshot的设计目的是在单细胞RNA测序数据中建模发展轨迹，并在降维和聚类后作为分析管道中的一个组件。它足够灵活，可以处理任意多个分支事件，并允许通过有监督的图构建纳入先验知识。

作者：Kelly Street[aut，cre，cph]，Davide Risso[aut]，Diya Das[aut]，Sandrine Dudoit[ths]，Koen Van den Berge[ctb]，Robrecht Cannoodt[ctb](，rcannood）

维护人员：凯利街<Street.Kelly at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“弹弓”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“弹弓”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“弹弓”）

生物视图	群集,差异表达式,基因表达式,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录组学,可视化
版本	2.12.0
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（6年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.0），主曲线（>=2.0.4），统计，轨迹实用程序
进口	图形、gr设备、，记录仪,矩阵统计、方法、，S4载体,单细胞实验,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/kstreet13/slingshot/issues网站

建议	生物遗传学,仿生风格,集群实验,延迟矩阵统计,针织物,麦克卢斯特,mgcv公司,R彩色啤酒,rgl公司,rmarkdown公司,测试那个,超高速,覆盖（covr）
链接到
增强功能
取决于我	OSCA.高级
导入我	调味品,scRNAseq应用程序,tradeSeq（交易序列）,特拉维兹
建议我	赛道ID
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	弹弓_2.12.0.tar.gz
Windows二进制	弹弓_2.12.0.zip
macOS二进制（x86_64）	弹弓2.12.0.tgz
macOS二进制（arm64）	弹弓2.12.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/slingshot
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/弹弓
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/slingshot/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/slingshot网站/
软件包下载报告	下载统计信息