scTreeViz软件
R/Bioconductor软件包，用于交互式探索和可视化带有层次注释的单细胞RNA-seq数据集
生物导体版本：释放（3.19）
scTreeViz提供类来支持交互式数据聚合和单细胞RNA-seq数据集的可视化，例如不同分辨率的细胞簇。“TreeIndex”类提供了一些方法来管理层次结构，并以给定的分辨率或跨分辨率拆分树。“TreeWiz”类扩展了“Summary dExperiment”，可以对集群定义的计数矩阵执行快速聚合。
作者：贾亚拉姆·坎切拉[aut，cre]，赫克托尔·科拉达·布拉沃[aut]，卡齐·塔斯尼姆·齐纳特[aut].斯蒂芬妮·希克斯[aut'
维护人员：Jayaram Kancherla<Jayaram.Kancherla在gmail.com>
引文（从R中输入引文（“scTreeViz”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“scTreeViz”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“scTreeViz”）
细节
| 生物视图 |
图形用户界面,基础设施,单个单元格,软件,可视化 |
| 版本 |
1.10.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.14（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.0），方法，epivizr公司,总结性实验 |
| 进口 |
数据表,S4载体,消化,矩阵,Rtsne公司,高温气冷堆,记录仪,聚类树,尖叫声,系统,epivizrData公司,epivizr服务器,gggraph图,散射,修拉,单细胞实验,ggplot2，统计，实用程序 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
