scRNAseq应用程序
单细胞RNAseq Shiny应用程序包
生物导体版本:释放(3.19)
scRNAseqApp是一个Shiny应用程序包,旨在实现单细胞数据的交互式可视化。它是源自ShinyCell的增强版本,经过重新打包以容纳多个数据集。该应用程序使用户能够同时可视化包含各种类型信息的数据,便于进行综合分析。此外,它还包括一个用户管理系统,用于管理不同用户的数据库可访问性。
作者:欧建宏〔aut,cre〕
维护人员:欧建宏(Jianhong Ou)<杜克教育学院的欧建宏>
引文(从R中输入引文(“scRNAseqApp”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“scRNAseqApp”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“scRNAseqApp”)
细节
生物视图 |
RNA序列,单个单元格,软件,可视化 |
版本 |
1.4.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.17(R-4.3)(1.5年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.3.0) |
进口 |
围巾,bslib数据库,绕圈子,复杂热图,数据表,数据库接口,DT公司,基因组范围,基因组信息Db,ggdendro公司,gg力,ggplot2,gg排斥,ggridges公司,gr设备,网格,额外网格,html工具,I范围,jsonlite公司,马格里特、方法、,拼凑,巧妙地,R彩色啤酒,参考管理器,rhdf5型,Rsamtools软件,RSQ网站,无线电跟踪器,S4载体,规模,加密,修拉,修饰符对象,闪亮的,闪光帮助者,闪耀经理人,弹弓,单细胞实验,可分类的、统计数据、工具,xfun游戏,xml语言2,实用程序 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/jianhong/scRNAseqApp网站 |
错误报告 |
https://github.com/jianhong/scRNAseqApp/issues网站 |
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。