sc合并
scMerge：合并多批scRNA-seq数据
生物导体版本：释放（3.19）
与所有基因表达数据一样，单细胞数据也存在批处理效应和其他不需要的变化，这使得准确的生物学解释变得困难。scMerge方法利用因子分析、稳定表达基因（SEG）和（伪）复制来消除不需要的变异并合并多个单细胞数据。此软件包包含scMerge管道中的所有必要功能，包括SEG识别、复制识别方法和单小区数据合并。
作者：Yingxin Lin[aut，cre]，Kevin Wang[aut]，悉尼生物信息学和生物识别集团[fnd]
维护人员：林英欣（Yingxin Lin）<悉尼爱德华州英欣（Yingxin.Lin）>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“scMerge”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“scMerge”）
细节
| 生物视图 |
BatchEffect（批次效果）,基因表达式,规范化,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录组学 |
| 版本 |
1.20.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.9（R-3.6）（5.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=3.6.0） |
| 进口 |
生物并行,BiocSingular公司,生物邻居,集群,DelayedArray（延迟阵列）,延迟矩阵统计,距离,记录仪,M3下降(>= 1.9.4),代理C,ruv（俄罗斯）,cv工具,散射,批处理器,尖叫声、方法、，S4载体(>= 0.23.19),单细胞实验(>= 1.7.3),总结性实验 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/SydneyBioX/sc合并 |
| 错误报告 |
https://github.com/SydneyBioX/scMerge/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
