射频预测

将rfPred功能预测分数分配给错义变量列表


生物导体版本:释放(3.19)

基于外部大量数据文件,其中rfPred得分是在人类外显子的所有基因组位置上预先计算的,该软件包为由染色体、位置(hg19版本)、参考核苷酸和替代核苷酸以及蛋白质的单蛋白标识符识别的错义变体提供rfPred评分。注意,为了使用该包,用户必须下载TabixFile和索引(大约3.3Go)。

作者:Fabienne Jabot-Hain、Hugo Varet和Jean-Philippe Jais

维护人员:雨果·瓦雷特(Hugo Varet)<varethugo at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“rfPred”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“rfPred”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“rfPred”)
使用PackagerfPred计算预记分 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 注释,分类,软件
版本 1.42.0
在生物导体中 生物技术2.13(R-3.0)(11年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.5.0),方法
进口 实用程序,基因组信息Db,数据表,I范围,基因组范围,平行,Rsamtools软件
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 rfPred_1.42.0.tar.gz号
Windows二进制 rfPred_1.42.0.zip文件(仅64位)
macOS二进制(x86_64) rfPred_1.42.0.tgz
macOS二进制(arm64) rfPred_1.42.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfPred
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rfPred
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/rfPred/
包短Url https://bioconductor.org/packages/rfPred/
软件包下载报告 下载统计信息