重新计票3

浏览并下载Retail3项目中的数据

生物导体版本：释放（3.19）

Retail3软件包可以访问大量来自人类和小鼠的统一处理的RNA-seq数据。您可以下载带有样本元数据和QC统计信息的基因、外显子或外显子-外显子连接级别的RangedSummarizedExperiment对象。此外，我们还提供对样本覆盖率BigWig文件的访问。

作者：莱昂纳多·科拉多·托雷斯

维护人员：莱昂纳多·科拉多·托雷斯<lcoladotor at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“重新叙述3”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“retail3”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“重新叙述3”）

生物视图	新闻报道,数据导入,差异表达式,基因表达式,RNA序列,排序,软件
版本	1.14.0
在生物导体中	生物柴油3.12（R-4.0）（4年）
许可证	艺术-2.0
取决于	总结性实验
进口	生物文件缓存、方法、，无线电跟踪器,S4载体，实用程序，高温气冷堆,数据表,R.utils公司,矩阵,基因组范围,sessioninfo（会话信息），工具
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/LieberInstitute/retail3
错误报告	https://github.com/LieberInstitute/retail3/issues网站

建议	仿生风格,覆盖（covr）,针织物,针织物,参考管理器,rmarkdown公司,测试那个,撬棍,交互式DisplayBase,重新计票
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	RNAseqQC（核糖核酸序列质量控制）
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	重新计票3_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	重新计票3_1.14.0.zip
macOS二进制（x86_64）	重新计票3_1.14.0.tgz
macOS二进制（arm64）	重新计票3_1.14.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/recount3（网址：https://git.bioconductor.org/packages/recount3）
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/重新计票3
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/retalt3/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/retail3/
软件包下载报告	下载统计信息