rcellminer公司
rcellminer:NCI-60细胞系的分子特征、药物反应和化学结构
生物导体版本:释放(3.19)
几十年来,NCI-60癌细胞株面板一直被用作抗癌药物筛选。该面板是作为发展治疗计划(DTP,http://dtp.nci.nih.gov/)美国国家癌症研究所(NCI)。在NCI-60上测试了数千种化合物,NCI-60具有基因和蛋白质表达、拷贝数、突变等多种平台的广泛特征(Reinhold等,2012年)。CellMiner项目的目的(http://discover.nci.nih.gov/cellminer)一直致力于整合来自多个平台的数据,用于分析NCI-60,并为NCI-60数据的探索提供一套强大的工具。
作者:Augustin Luna、Vinodh Rajapakse、Fabricio Sousa
维护人员:奥古斯汀·卢纳(Augustin Luna)、维诺德·拉贾帕克塞(Vinodh Rajapakse)、法蒂·埃卢米(Fathi Elloumi)、法提·埃卢姆(Fathi.Elloumi)
引文(从R中输入引文(“rcellminer”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“rcellminer”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“rcellminer”)
细节
生物视图 |
基于细胞的分析,化学信息学,副本编号变化,基因表达式,药物遗传学,药物基因组学,软件,系统生物学,可视化,aCGH公司,微小RNA |
版本 |
2.26.0 |
在生物导体中 |
生物多样性3.1(R-3.2)(9.5年) |
许可证 |
LGPL-3+文件许可证 |
取决于 |
R(>=3.2),博科生物,rcellminer数据(>= 2.0.0) |
进口 |
字符串,gplots(gplots),ggplot2,方法,统计,实用程序,闪亮的 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
http://discover.nci.nih.gov/cellminer网站/ |
查看更多
建议 |
针织物,R彩色啤酒,平方英尺,生物遗传学,测试那个,仿生风格,jsonlite公司,热铺层,格尔姆奈特,foreach公司,多斯诺,平行,rmarkdown公司 |
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