rcellminer公司

rcellminer:NCI-60细胞系的分子特征、药物反应和化学结构


生物导体版本:释放(3.19)

几十年来,NCI-60癌细胞株面板一直被用作抗癌药物筛选。该面板是作为发展治疗计划(DTP,http://dtp.nci.nih.gov/)美国国家癌症研究所(NCI)。在NCI-60上测试了数千种化合物,NCI-60具有基因和蛋白质表达、拷贝数、突变等多种平台的广泛特征(Reinhold等,2012年)。CellMiner项目的目的(http://discover.nci.nih.gov/cellminer)一直致力于整合来自多个平台的数据,用于分析NCI-60,并为NCI-60数据的探索提供一套强大的工具。

作者:Augustin Luna、Vinodh Rajapakse、Fabricio Sousa

维护人员:奥古斯汀·卢纳(Augustin Luna)、维诺德·拉贾帕克塞(Vinodh Rajapakse)、法蒂·埃卢米(Fathi Elloumi)、法提·埃卢姆(Fathi.Elloumi)

引文(从R中输入引文(“rcellminer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“rcellminer”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“rcellminer”)
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许可证 文本

细节

生物视图 基于细胞的分析,化学信息学,副本编号变化,基因表达式,药物遗传学,药物基因组学,软件,系统生物学,可视化,aCGH公司,微小RNA
版本 2.26.0
在生物导体中 生物多样性3.1(R-3.2)(9.5年)
许可证 LGPL-3+文件许可证
取决于 R(>=3.2),博科生物,rcellminer数据(>= 2.0.0)
进口 字符串,gplots(gplots),ggplot2,方法,统计,实用程序,闪亮的
系统要求
统一资源定位地址 http://discover.nci.nih.gov/cellminer网站/
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程序包档案

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源程序包 rcellminer_2.26.0.tar.gz公司
Windows二进制 rcellminer_2.26.0.zip码(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 铁矿石_2.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) rcellminer_2.26.0.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcellminer网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rcellminer
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/rcellminer网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/rcellminer网站/
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