qsvaR公司

生成退化校正的质量替代变量分析


生物导体版本:释放(3.19)

qsvaR软件包包含用于消除死后脑组织中rna-seq数据退化影响的功能。该软件包用于帮助用户生成与降级相关的主要组件。这些成分可用于差异表达分析,以消除降解的影响。

作者:约书亚·斯托尔兹,赫迪亚·特纳尼[ctb,cre],莱昂纳多·科拉多·托雷斯

维护人员:Hedia Tnani<hediatnani0 at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“qsvaR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“qsvaR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“qsvaR”)
qsvaR简介 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 生物学问题,新闻报道,差异表达式,规范化,排序,软件,工作流步骤
版本 1.8.0
在生物导体中 生物柴油3.15(R-4.2)(2.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.2),总结性实验
进口 特别行政区,统计,ggplot2,方法
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/LieberInstitute/qsvaR
错误报告 https://support.bioconductor.org/t/qsvaR
查看更多
建议 生物文件缓存,仿生风格,覆盖(covr),针织物,利马,参考管理器,rmarkdown公司,sessioninfo(会话信息),测试那个(>= 3.0.0)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 qsvaR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 qsvaR_1.8.0.zip码
macOS二进制(x86_64) qsvaR_1.8.0.tgz
macOS二进制(arm64) qsvaR_1.8.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qsvaR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/qsvaR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/qsvaR网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/qsvaR/
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