plyranges系列
操作GenomicRanges的流畅界面
生物导体版本:释放(3.19)
一个类似dplyr的接口,用于与常见的生物导体类Ranges和GenomicRanges交互。通过提供语法和一致的方式来操作这些类,希望能够增加新Bioconductor用户的可访问性。
作者:斯图尔特·李、迈克尔·劳伦斯[aut,ctb]、戴安娜·库克[aut、ctb]和斯宾塞·奈斯特罗姆[ctb]、皮尔雷·鲍尔·阿希萨[ctb]、迈克尔·洛夫[ctb,cre]
维护人员:迈克尔·洛夫(Michael Love)<michaelisaiahlove at gmail.com>
引文(从R中输入引文(“plyranges”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“plyranges”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“plyranges”)
细节
生物视图 |
新闻报道,数据表示,基础设施,软件,工作流步骤 |
版本 |
1.24.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.7(R-3.5)(6.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=3.5),生物遗传学,I范围(>= 2.12.0),基因组范围(>= 1.28.4) |
进口 |
方法,数字播放器,爱尔兰航空公司(>= 0.2.0),马格里特,潮汐选择(>= 1.0.0),无线电跟踪器,基因组比对,基因组信息Db,Rsamtools软件,S4载体(>=0.23.10),实用工具 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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错误报告 |
https://github.com/tidyomics/plyranges网站 |
查看更多
建议 |
针织物,仿生风格,rmarkdown公司,测试那个(>= 2.1.0),HelloRanges(HelloRange),HelloRangesData(你好范围数据),英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,pasillaBamSubset系列,覆盖(covr),ggplot2 |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
BOBaFIT公司,BUSpaRse公司,cfDNAPro公司,少女,基因组图,InPAS公司,卡特探测器,水手,甲基CC,多棱镜,nearBynding公司,空范围,绘图员,交互作用,SARC公司,潮汐学,fluent基因组学,摩卡 |
建议我 |
额外ChIP,模因,svaNUMT公司,svaRetro公司,tidyCoverage公司,CTCF公司 |
指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。