幻影Lite

加载和注释RNA-seq计数矩阵


生物导体版本:释放(3.19)

PhantasusLite–一个轻量级软件包,包含从phantasus软件包中提取的通用帮助函数。在parituclar中,它通过提供对远程HSDS存储库的访问,以及ARCHS4和DEE2项目中预先计算的基因计数,简化了对GEO公共RNA-seq数据集的处理。

作者:丽塔·萨布利纳[aut],马克西姆·克莱沃洛夫[aut]Alexey Sergushichev[aut,cre]

维护人员:Alexey Sergushichev<gmail.com上的alsergbox>

引文(从R中输入引文(“phantasusLite”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“phantasusLite”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“phantasusLite”)
phantasusLite教程 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 基因表达式,RNA序列,软件,转录组学
版本 1.2.0
在生物导体中 生物柴油3.18(R-4.3)(1年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.2)
进口 数据表,rhdf5客户端(>= 1.25.1),高温气冷堆,字符串,统计数据,实用程序,博科生物,方法
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/ctlab/phantasusLite网站/
错误报告 https://github.com/ctlab/phantasusLite/issues
查看更多
建议 测试那个(>= 3.0.0),针织物,rmarkdown公司,仿生风格,rhdf5型,地理查询
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 幻影Lite_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 幻影Lite_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64) 幻影Lite_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64) 幻影Lite_1.2.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phantasusLite网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/phatasusLite
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/phantasusLite网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/phantasusLite网站/
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