个体过程
解剖本体、细胞系等的处理
生物导体版本:释放(3.19)
支持获取不同的生物信息本体,特别是使用CRAN上的本体索引包。我们提供有关细胞、细胞系、化合物和解剖学的关键本体的快照,以帮助分析基因组规模的实验,尤其是细胞x化合物屏幕。另一个目的是加强开发引人注目的用例,以便为新兴本体提供更丰富的接口。
作者:文森特·凯里,萨拉·斯坦基维茨
维护人员:文森特·凯里在channing.harvard.edu>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“ontoProc”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“ontoProc”)
细节
生物视图 |
GO(开始),基础设施,软件 |
版本 |
1.26.4 |
在生物导体中 |
生物技术3.6(R-3.4)(7年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.0),本体索引 |
进口 |
博科生物,S4载体,方法,统计,实用程序,生物文件缓存,闪亮的,图表,Rgraphviz公司,本体论图,数字播放器,马格里特,DT公司,记录仪,批注中心,总结性实验,网状的,R.utils公司,高温气冷堆 |
系统要求 |
猫头鹰2 |
统一资源定位地址 |
https://github.com/vjcitn/ontoProc |
错误报告 |
https://github.com/vjcitn/ontoProc/issues |
查看更多
建议 |
针织物,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,测试那个,仿生风格,单细胞实验,细胞索引,rmarkdown公司,注释Dbi,魔法 |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
单一RBook |
导入我 |
波哥斯人,tenXplore公司 |
建议我 |
生物OncoTK,scDiffCom公司 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。