核子模拟

生成合成核小体图


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包可以生成一个包含核小体区域读操作的合成图,以及一个包含模拟下一代测序的正向和反向读操作的综合图。还可以生成“平铺阵列”的合成杂交数据。用户可以在三种不同的阅读定位分布之间进行选择:普通、学生和制服。此外,还提供了一个可视化工具来探索合成核小体图。

作者:Rawane Samb[aut],Astrid Deschánes[cre,aut],帕斯卡·贝劳[aut],阿诺·德罗特[aut]

维护人员:Astrid Deschánes<adeschen at hotmail.com>

引文(从R中输入引文(“nucleoSim”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“nucleoSim”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“nucleoSim”)
生成合成核小体图 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 对齐,遗传学,排序,软件,统计方法
版本 1.32.0
在生物导体中 生物多样性3.3(R-3.3)(8.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于
进口 统计数据,I范围,S4载体、图形、方法
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/arnauddroitlab/nucleSim
错误报告 https://github.com/arnauddroitlab/neuroSim/insues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 核子Sim_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 核子Sim_1.32.0.zip
macOS二进制(x86_64) 核子Sim_1.32.0.tgz
macOS二进制(arm64) 核素Sim_1.32.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nucleoSim网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/nucleSim
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/neuroSim/
包短Url https://bioconductor.org/packages/nucleoSim/
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